15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1725 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1725  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3165  hypothetical protein  32.14 
 
 
176 aa  101  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.186856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2070  hypothetical protein  29.48 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000170748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2397  hypothetical protein  27.12 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0498764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3019  hypothetical protein  26.32 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250894  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  32.89 
 
 
223 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3073  hypothetical protein  36 
 
 
165 aa  48.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.590013  normal  0.400925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  31.4 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  29.76 
 
 
185 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  29.41 
 
 
184 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1431  hypothetical protein  25.15 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2140  hypothetical protein  35.06 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  29.87 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  22.22 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  25.32 
 
 
186 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>