17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3073 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3073  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  338  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.590013  normal  0.400925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  27.61 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0379  hypothetical protein  29.53 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0442  hypothetical protein  27.94 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  35.48 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1605  hypothetical protein  27.74 
 
 		 174 aa  50.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  34.18 
 
 		 315 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1725  hypothetical protein  36 
 
 		 177 aa  48.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  31.88 
 
 		 223 aa  47.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2140  hypothetical protein  28.69 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  29.08 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  34.92 
 
 		 205 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  36 
 
 		 184 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  44.3  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2070  hypothetical protein  34.78 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000170748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  36 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  32 
 
 		 189 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>