34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1359 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  332  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0872  hypothetical protein  39.44 
 
 
169 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363349  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  34.07 
 
 
223 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  31.34 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3073  hypothetical protein  27.61 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.590013  normal  0.400925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0442  hypothetical protein  29.32 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2140  hypothetical protein  29.86 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  28.68 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2139  hypothetical protein  29.46 
 
 
162 aa  54.3  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0379  hypothetical protein  28.26 
 
 
172 aa  53.9  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  24.29 
 
 
216 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  33.77 
 
 
184 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  26.8 
 
 
186 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1077  hypothetical protein  24.64 
 
 
178 aa  51.2  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  35.07 
 
 
252 aa  50.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2070  hypothetical protein  30.77 
 
 
211 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000170748 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  28.76 
 
 
186 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  35.14 
 
 
209 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1681  hypothetical protein  28.57 
 
 
186 aa  48.5  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0467098  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1605  hypothetical protein  31.25 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  29.27 
 
 
199 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  25.33 
 
 
185 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  27.66 
 
 
189 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1725  hypothetical protein  29.87 
 
 
177 aa  44.3  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  23.48 
 
 
205 aa  44.3  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  27.48 
 
 
315 aa  43.9  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  21.31 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  39.39 
 
 
186 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  30.12 
 
 
196 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1076  hypothetical protein  23.91 
 
 
167 aa  41.2  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  30.67 
 
 
206 aa  41.2  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  30.67 
 
 
248 aa  40.8  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3165  hypothetical protein  28.09 
 
 
176 aa  40.4  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.186856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  30.67 
 
 
206 aa  40.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.196388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>