30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4633 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  60.29 
 
 
248 aa  209  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  61.76 
 
 
206 aa  209  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.196388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  60.29 
 
 
206 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  57.5 
 
 
196 aa  168  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  58.5 
 
 
197 aa  167  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  39.34 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  44.44 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  39.52 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  37.04 
 
 
216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  44.37 
 
 
186 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  35.61 
 
 
200 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  42.75 
 
 
186 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  40.71 
 
 
189 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  35.18 
 
 
223 aa  98.6  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  34.55 
 
 
205 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  37.21 
 
 
185 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  32.16 
 
 
205 aa  87.8  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1646  hypothetical protein  39.66 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1936  hypothetical protein  32.39 
 
 
224 aa  75.5  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  36.77 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1258  hypothetical protein  30.77 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1219  hypothetical protein  30.13 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  34.5 
 
 
252 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  30.82 
 
 
315 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  46.38 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  38.46 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  29.27 
 
 
165 aa  44.7  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1527  hypothetical protein  36.76 
 
 
245 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173239  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1605  hypothetical protein  33.72 
 
 
174 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>