34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0930 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  440  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  32.99 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  35.21 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  32.72 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  37.27 
 
 		 248 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  37.27 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  36.82 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.196388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  35.71 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  43.27 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  35.47 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  37.04 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  33.96 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  35.04 
 
 		 186 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  30.23 
 
 		 185 aa  91.3  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  29.74 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  32.62 
 
 		 185 aa  88.6  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  38.59 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  32.57 
 
 		 189 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  31.41 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1936  hypothetical protein  30.32 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1646  hypothetical protein  36.99 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1258  hypothetical protein  27.56 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1219  hypothetical protein  27.56 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  25.71 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  29.13 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  24.29 
 
 		 165 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  28.15 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2097  hypothetical protein  25.55 
 
 		 147 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.168181  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1527  hypothetical protein  28.12 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173239  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  40.91 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3073  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.590013  normal  0.400925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1725  hypothetical protein  22.22 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3165  hypothetical protein  24.18 
 
 		 176 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.186856 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>