16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0872 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0872  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  39.44 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2140  hypothetical protein  31.65 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0442  hypothetical protein  35.87 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2139  hypothetical protein  29.92 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  31.34 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  27.66 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  31.34 
 
 		 223 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  29.2 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1681  hypothetical protein  25.64 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0467098  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2591  hypothetical protein  26.12 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107466  normal  0.163564 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1605  hypothetical protein  38.03 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  35.63 
 
 		 197 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0379  hypothetical protein  30.3 
 
 		 172 aa  44.3  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  35.14 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  31.75 
 
 		 185 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>