28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3746 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  362  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  30.82 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  26.92 
 
 
223 aa  79  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  27.88 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  30.99 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  31.45 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  27.57 
 
 
186 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  25.71 
 
 
216 aa  62.8  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  30.11 
 
 
205 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  28.46 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  25.73 
 
 
184 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  28.05 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  24.49 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  32.97 
 
 
185 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1646  hypothetical protein  37.5 
 
 
185 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  39.74 
 
 
206 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.196388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  28.47 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0872  hypothetical protein  27.66 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363349  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1527  hypothetical protein  29.92 
 
 
245 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173239  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  38.46 
 
 
199 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_004310  BR1258  hypothetical protein  29.68 
 
 
220 aa  49.3  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1219  hypothetical protein  29.68 
 
 
233 aa  48.9  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  37.18 
 
 
248 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  30.23 
 
 
315 aa  48.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  32.8 
 
 
252 aa  47.8  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  37.18 
 
 
206 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1936  hypothetical protein  26.43 
 
 
224 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  34.62 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>