19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0442 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0442  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  308  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2140  hypothetical protein  32.09 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1077  hypothetical protein  32.31 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2139  hypothetical protein  35.11 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1076  hypothetical protein  34.51 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1605  hypothetical protein  34.33 
 
 
174 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  29.32 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  33.61 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0379  hypothetical protein  34.96 
 
 
172 aa  61.6  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0872  hypothetical protein  35.87 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363349  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1681  hypothetical protein  31.16 
 
 
186 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0467098  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  32.06 
 
 
223 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3073  hypothetical protein  27.94 
 
 
165 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.590013  normal  0.400925 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0389  hypothetical protein  22.96 
 
 
138 aa  48.5  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  30.83 
 
 
205 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2591  hypothetical protein  27.41 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107466  normal  0.163564 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  26.15 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  28.57 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  33.82 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>