37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1854 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  100 
 
 
205 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  89.32 
 
 
205 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  43.31 
 
 
200 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1936  hypothetical protein  38.31 
 
 
224 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  30.48 
 
 
223 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  33.33 
 
 
209 aa  99  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1258  hypothetical protein  35.71 
 
 
220 aa  92.4  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  29.74 
 
 
216 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1219  hypothetical protein  35.06 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  34.04 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  31.33 
 
 
185 aa  84.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  35.29 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  35.29 
 
 
248 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  34.78 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  34.64 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.196388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  35.29 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  30.43 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  35.37 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  33.94 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  32.61 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  34.43 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  28.78 
 
 
315 aa  63.5  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  27.87 
 
 
189 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  30.11 
 
 
182 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1646  hypothetical protein  38.36 
 
 
185 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2070  hypothetical protein  28.28 
 
 
211 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000170748 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1527  hypothetical protein  30.86 
 
 
245 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173239  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  35.21 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  28.99 
 
 
252 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0442  hypothetical protein  30.83 
 
 
155 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1681  hypothetical protein  29.23 
 
 
186 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0467098  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3073  hypothetical protein  29.08 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.590013  normal  0.400925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  23.48 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6079  hypothetical protein  33.82 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1565  hypothetical protein  33.82 
 
 
223 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.333128  normal  0.716752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  23.57 
 
 
166 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3019  hypothetical protein  30.95 
 
 
195 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250894  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>