12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1077 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1077  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  368  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1076  hypothetical protein  35.46 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0442  hypothetical protein  32.31 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  24.83 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  24.64 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  27.21 
 
 		 223 aa  51.2  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  25.34 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2139  hypothetical protein  27.34 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2140  hypothetical protein  23.44 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1527  hypothetical protein  27.78 
 
 		 245 aa  45.1  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173239  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  31.51 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0379  hypothetical protein  27.56 
 
 		 172 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>