29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1527 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1527  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  499  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173239  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  43.48 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  37.5 
 
 		 315 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1102  hypothetical protein  41.86 
 
 		 223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  0.0200778 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1565  hypothetical protein  42.35 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.333128  normal  0.716752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6079  hypothetical protein  42.68 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  30.29 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  32.56 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  29.41 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  28.12 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  31.2 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  30.77 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  29.92 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  32.43 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  26.55 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  26.11 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  27.4 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  27.19 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1077  hypothetical protein  25.61 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  28.28 
 
 		 166 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  27.93 
 
 		 186 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1681  hypothetical protein  25.68 
 
 		 186 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0467098  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0442  hypothetical protein  25.81 
 
 		 155 aa  45.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  26.96 
 
 		 185 aa  45.4  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  29.57 
 
 		 185 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1258  hypothetical protein  25.87 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  39.71 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0872  hypothetical protein  28.03 
 
 		 169 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  36.76 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>