25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1258 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1258  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  448  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1219  hypothetical protein  99.55 
 
 
233 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1936  hypothetical protein  67.89 
 
 
224 aa  293  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  29.72 
 
 
209 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  35.71 
 
 
205 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  36.36 
 
 
205 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  30.67 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  28.17 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  27.56 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  28.22 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  40.4 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.196388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  31.87 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  31.84 
 
 
206 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  30.16 
 
 
186 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  29.59 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  29.79 
 
 
185 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  30.77 
 
 
199 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  29.93 
 
 
186 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  29.08 
 
 
185 aa  55.1  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  38.1 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  37.8 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  29.68 
 
 
182 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  26.21 
 
 
189 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1646  hypothetical protein  33.77 
 
 
185 aa  45.1  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  29.55 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>