16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1681 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1681  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0467098  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  26.57 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0442  hypothetical protein  31.16 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  32.31 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2140  hypothetical protein  28.99 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  27.46 
 
 		 166 aa  51.6  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2139  hypothetical protein  27.41 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0872  hypothetical protein  25.64 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  29.23 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  37.29 
 
 		 242 aa  45.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0379  hypothetical protein  27.85 
 
 		 172 aa  45.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  30.65 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  27.43 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1527  hypothetical protein  29.21 
 
 		 245 aa  42.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173239  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  32.73 
 
 		 315 aa  40.8  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>