12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2139 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2139  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2140  hypothetical protein  54.14 
 
 
165 aa  175  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0442  hypothetical protein  35.11 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  28.99 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1076  hypothetical protein  31.08 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0872  hypothetical protein  29.92 
 
 
169 aa  55.1  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363349  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  29.46 
 
 
165 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0379  hypothetical protein  29.2 
 
 
172 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1681  hypothetical protein  27.41 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0467098  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1077  hypothetical protein  27.34 
 
 
178 aa  47.4  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  34.09 
 
 
216 aa  41.2  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  29.23 
 
 
182 aa  40.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal 
 
 
-
 
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