16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2140 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2140  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  331  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2139  hypothetical protein  54.14 
 
 		 162 aa  175  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0442  hypothetical protein  32.09 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  29.63 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  29.86 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0872  hypothetical protein  31.65 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.363349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1076  hypothetical protein  29.08 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1681  hypothetical protein  28.99 
 
 		 186 aa  53.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0467098  normal  0.109916 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1077  hypothetical protein  23.44 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3073  hypothetical protein  28.69 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.590013  normal  0.400925 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  29.67 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1725  hypothetical protein  35.06 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  23.91 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3165  hypothetical protein  26.32 
 
 		 176 aa  42  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.186856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2070  hypothetical protein  35.94 
 
 		 211 aa  40.8  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000170748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  25.2 
 
 		 200 aa  40.8  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>