19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1565 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1565  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.333128  normal  0.716752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6079  hypothetical protein  97.78 
 
 		 225 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1102  hypothetical protein  77.83 
 
 		 223 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  0.0200778 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  49.19 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1527  hypothetical protein  42.35 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173239  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  35.14 
 
 		 315 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  31.82 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  33.08 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  31.37 
 
 		 186 aa  52.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  32 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  31.58 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  28.8 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  29.2 
 
 		 186 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  29.93 
 
 		 184 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  29.89 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  31.18 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  33.82 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  28.99 
 
 		 189 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  33.82 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>