30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3935 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  489  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1527  hypothetical protein  43.27 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173239  normal  0.19078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  47.17 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1102  hypothetical protein  48.3 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  0.0200778 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1565  hypothetical protein  51.95 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.333128  normal  0.716752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6079  hypothetical protein  51.3 
 
 		 225 aa  118  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  36.92 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  35.66 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  36.23 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  30.77 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  28.98 
 
 		 189 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  29.83 
 
 		 184 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  47.14 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  44.93 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  35.07 
 
 		 165 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  32.06 
 
 		 205 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  28.99 
 
 		 205 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  43.48 
 
 		 197 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  32.8 
 
 		 182 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  30.37 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  41.43 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.196388 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  35.8 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  43.75 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  43.75 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0103  hypothetical protein  29.86 
 
 		 166 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  29.66 
 
 		 185 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  28.33 
 
 		 185 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  30.86 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1605  hypothetical protein  32.99 
 
 		 174 aa  43.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>