29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1318 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1646  hypothetical protein  87.03 
 
 		 185 aa  288  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  61.29 
 
 		 186 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  59.24 
 
 		 184 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  58.92 
 
 		 185 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  57.53 
 
 		 186 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3899  protein of unknown function DUF1457  54.01 
 
 		 189 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4633  hypothetical protein  39.34 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.367804  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  32.62 
 
 		 216 aa  88.6  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  31.21 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2216  protein of unknown function DUF1457  39.72 
 
 		 206 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.196388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2534  protein of unknown function DUF1457  39.01 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.573206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2259  hypothetical protein  39.01 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0461584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  32.61 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  33.12 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  28.06 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  31.97 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1076  hypothetical protein  30.77 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00643993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5126  protein of unknown function DUF1457  34.12 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1936  hypothetical protein  34.03 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3233  hypothetical protein  37.8 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0701746  normal  0.515147 
 
 
-
 
NC_004310  BR1258  hypothetical protein  29.08 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1219  hypothetical protein  28.57 
 
 		 233 aa  54.3  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3746  hypothetical protein  32.97 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0768901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2442  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000723195 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3165  hypothetical protein  26.38 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.186856 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3935  hypothetical protein  29.66 
 
 		 252 aa  45.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1268  hypothetical protein  32.53 
 
 		 315 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1102  hypothetical protein  32.14 
 
 		 223 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  0.0200778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>