15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3165 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3165  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  363  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.186856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1725  hypothetical protein  32.14 
 
 		 177 aa  101  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2070  hypothetical protein  26.79 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000170748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2397  hypothetical protein  24.1 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  26.62 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3019  hypothetical protein  27.5 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  26.4 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1318  hypothetical protein  26.38 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  25.71 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  26.95 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  22.88 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5216  hypothetical protein  27.2 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.897887  normal  0.15918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0930  hypothetical protein  24.18 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.432355 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2140  hypothetical protein  26.32 
 
 		 165 aa  42  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1261  hypothetical protein  24.07 
 
 		 223 aa  40.8  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>