16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2070 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2070  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  434  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000170748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1725  hypothetical protein  29.48 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3019  hypothetical protein  31.61 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3165  hypothetical protein  26.79 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.468528  normal  0.186856 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2151  hypothetical protein  30.37 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0990519  normal  0.164648 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3273  hypothetical protein  29.1 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00114404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2645  hypothetical protein  21.34 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.421367  normal  0.712081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3130  hypothetical protein  25 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0916882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1854  protein of unknown function DUF1457  28.28 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142291  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2054  protein of unknown function DUF1457  29.85 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.592031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2397  hypothetical protein  23.31 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1359  hypothetical protein  30.77 
 
 		 165 aa  49.7  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3073  hypothetical protein  34.78 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.590013  normal  0.400925 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1724  hypothetical protein  22.22 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1261  hypothetical protein  26.16 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1044  hypothetical protein  22.46 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>