26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1558 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1558  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 371 aa  752    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00301  putative phytase  51.52 
 
 		 373 aa  359  5e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0399037  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  36.84 
 
 		 373 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2977  NHL repeat containing protein  34.13 
 
 		 665 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0272113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4719  phytase  26.1 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  32.76 
 
 		 930 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2400  hypothetical protein  23.35 
 
 		 340 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.830648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  43.4 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  26.53 
 
 		 903 aa  46.2  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  30.77 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  32.61 
 
 		 930 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  34.78 
 
 		 831 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 639 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  25.27 
 
 		 668 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  31.82 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  29.91 
 
 		 359 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  34.62 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  34.04 
 
 		 525 aa  44.3  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  28.57 
 
 		 676 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  33.87 
 
 		 1177 aa  43.9  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  33.82 
 
 		 379 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  34.41 
 
 		 627 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  32.82 
 
 		 579 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 1230 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  34.09 
 
 		 588 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  27.93 
 
 		 354 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>