30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4719 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4719  phytase  100 
 
 
358 aa  734    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2400  hypothetical protein  70.38 
 
 
340 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.830648  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1367  phytase  55.98 
 
 
352 aa  381  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1035  3-phytase  56.46 
 
 
350 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1536  phytase  50.56 
 
 
356 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.4705 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0101  phytase  52.51 
 
 
352 aa  361  1e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1122  phytase  52.11 
 
 
352 aa  351  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3999  phytase  32.26 
 
 
1844 aa  149  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4199  3-phytase  34.09 
 
 
436 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4238  3-phytase  34.09 
 
 
436 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408008 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04140  conserved hypothetical protein  31.7 
 
 
736 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.141129  normal  0.735382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4063  3-phytase  30.65 
 
 
651 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3241  phytase domain protein  28.41 
 
 
640 aa  109  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04970  Phytase domain protein  30.49 
 
 
663 aa  109  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1644  3-phytase  29.49 
 
 
450 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3999  3-phytase  29.1 
 
 
692 aa  105  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.739882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5553  3-phytase  29.29 
 
 
424 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.617284 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2368  3-phytase  28.99 
 
 
345 aa  100  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.95942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1892  3-phytase  30.77 
 
 
653 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02401  putative phytase domain protein  26.65 
 
 
738 aa  99.4  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2083  3-phytase  30.8 
 
 
645 aa  99  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829168  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2110  3-phytase  31.17 
 
 
690 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0321159  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2208  phytase  31.37 
 
 
653 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0531  3-phytase  30.58 
 
 
353 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.258682  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2524  phytase, putative  29.02 
 
 
661 aa  89.4  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5955  3-phytase  27.41 
 
 
418 aa  85.9  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2879  phytase  25.27 
 
 
463 aa  76.3  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172144  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00301  putative phytase  24.61 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0399037  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3124  3-phytase  24.67 
 
 
342 aa  67  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1558  NHL repeat containing protein  25.56 
 
 
371 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185852  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>