More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1491 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1491  band 7 protein  100 
 
 		 368 aa  754    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0171305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0570  band 7 protein  54.1 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2638  band 7 protein  35.69 
 
 		 499 aa  253  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.685729  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1471  band 7 protein  36.71 
 
 		 383 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0676  band 7 protein  38.25 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.7 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0577091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2837  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin-like  35.56 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4670  band 7 protein  38.14 
 
 		 379 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3693  band 7 protein  38.14 
 
 		 379 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3828  band 7 protein  38.14 
 
 		 379 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.549806  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1571  band 7 protein  35.28 
 
 		 508 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3588  band 7 protein  41.72 
 
 		 379 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.574317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5224  hypothetical protein  37.53 
 
 		 381 aa  199  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4641  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.31 
 
 		 512 aa  199  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000031731  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5433  band 7 protein  40.73 
 
 		 379 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60630  hypothetical protein  37.27 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4569  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.83 
 
 		 375 aa  192  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4260  SPFH domain-containing protein  35.83 
 
 		 375 aa  192  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.246951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1195  band 7 protein  36.71 
 
 		 380 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4422  band 7 protein  37.72 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0275  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.56 
 
 		 383 aa  179  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660348  hitchhiker  0.0026961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3892  band 7 protein  32.98 
 
 		 374 aa  177  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2630  band 7 protein  27.85 
 
 		 521 aa  136  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1052  band 7 protein  34.73 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0515  band 7 protein  31.19 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5164  band 7 protein  30.23 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0012  band 7 protein  23.79 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1233  Band 7 protein  27.05 
 
 		 254 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  25.65 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  27.55 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  23.62 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  26.52 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  28.09 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  25 
 
 		 250 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1784  band 7 protein  26.32 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131245  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  25.12 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  23.65 
 
 		 261 aa  72  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  25.58 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1164  band 7 protein  26.73 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00105644  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  24.27 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  28.17 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  26.82 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3885  band 7 protein  25.79 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  23.45 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  24.88 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1623  band 7 protein  29.01 
 
 		 268 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  28.3 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  24.07 
 
 		 263 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  26.39 
 
 		 281 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  27.43 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.01 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0769  band 7 protein  28.74 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.953295  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  25.7 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0290  band 7 protein  29.01 
 
 		 268 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0917443  normal  0.201175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  29.07 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  31.54 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  24.53 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  25.57 
 
 		 254 aa  67  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  24.02 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  28.46 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1659  hypothetical protein  26.03 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.57 
 
 		 257 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  23.67 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  23.08 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  26.13 
 
 		 257 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  30 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  27.69 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  26.75 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  23.7 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1525  band 7 protein  27.54 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  26.11 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0544  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.79 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  26.16 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  24.07 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  31.54 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  26.16 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  26.16 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  21.56 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  24.49 
 
 		 249 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  25.64 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  26.16 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  24.55 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5265  band 7 protein  24.74 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5594  band 7 protein  24.74 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  30.77 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  23.44 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  28.46 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.92 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  30.77 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1713  band 7 protein  24.21 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.29 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.76 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0832  band 7 protein  30.71 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.687867  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2800  band 7 protein  25.58 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2766  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.49 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  24.29 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.81 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.24 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  23.38 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  25.48 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.464796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>