288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4422 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4422  band 7 protein  100 
 
 		 382 aa  759    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1471  band 7 protein  66.06 
 
 		 383 aa  507  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0676  band 7 protein  65.44 
 
 		 379 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5224  hypothetical protein  63.06 
 
 		 381 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60630  hypothetical protein  62.53 
 
 		 381 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3828  band 7 protein  62.23 
 
 		 379 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.549806  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4670  band 7 protein  62.23 
 
 		 379 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1195  band 7 protein  60.64 
 
 		 380 aa  455  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3693  band 7 protein  62.23 
 
 		 379 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  61.44 
 
 		 380 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0577091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3588  band 7 protein  62.23 
 
 		 379 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.574317 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5433  band 7 protein  61.97 
 
 		 379 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4260  SPFH domain-containing protein  52.77 
 
 		 375 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.246951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4569  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.51 
 
 		 375 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4641  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.88 
 
 		 512 aa  311  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000031731  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1571  band 7 protein  44.95 
 
 		 508 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0275  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.6 
 
 		 383 aa  289  6e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660348  hitchhiker  0.0026961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3892  band 7 protein  42.26 
 
 		 374 aa  276  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2837  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin-like  35.96 
 
 		 368 aa  203  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2638  band 7 protein  33.71 
 
 		 499 aa  202  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.685729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0012  band 7 protein  38.97 
 
 		 297 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0570  band 7 protein  33.79 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1491  band 7 protein  37.32 
 
 		 368 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0171305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2630  band 7 protein  26.6 
 
 		 521 aa  103  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0515  band 7 protein  30.35 
 
 		 256 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5164  band 7 protein  32.89 
 
 		 298 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1052  band 7 protein  28.98 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  31.74 
 
 		 261 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  31.4 
 
 		 281 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  32.38 
 
 		 265 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  29.41 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  27.96 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  30.38 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2530  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.81 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  28.02 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  30.29 
 
 		 258 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2412  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.96 
 
 		 270 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163549  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  30.64 
 
 		 259 aa  82.4  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.06 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  27.01 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  32.06 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2766  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.67 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2191  band 7 protein  26.73 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  27.23 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  27.49 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.99 
 
 		 278 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  27.49 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.77 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  29.81 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0067  band 7 protein  28.57 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.49 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1233  Band 7 protein  28.82 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  27.49 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  27.49 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  27.49 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.81 
 
 		 261 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  27.49 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0018  band 7 protein  30.73 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.49 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.76 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  25.74 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  27.49 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4388  band 7 protein  27.49 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1806  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.49 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175938  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1164  band 7 protein  30.06 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00105644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  29.82 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  25.76 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2886  hypothetical protein  26.73 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.18 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  29.71 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  25 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  25.74 
 
 		 267 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  26.54 
 
 		 259 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  29.41 
 
 		 249 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2659  band 7 protein  25.74 
 
 		 266 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37049  normal  0.0645118 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  29.34 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  30.33 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1643  band 7 protein  26.73 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182156  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  27.92 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  30.36 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  25 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.24 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  27.91 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.07 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  26.07 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  27.91 
 
 		 259 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.44 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3028  hypothetical protein  27.54 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  26.5 
 
 		 263 aa  73.2  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  29.26 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  25.13 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  27.54 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  27.32 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  26.35 
 
 		 249 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  28.14 
 
 		 248 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3547  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.61 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105292  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  24.75 
 
 		 252 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  29.17 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>