More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1571 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4641  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  78.7 
 
 
512 aa  830    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000031731  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1571  band 7 protein  100 
 
 
508 aa  1032    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5224  hypothetical protein  45.36 
 
 
381 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60630  hypothetical protein  45.09 
 
 
381 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4670  band 7 protein  46.3 
 
 
379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3693  band 7 protein  46.3 
 
 
379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0676  band 7 protein  45.33 
 
 
379 aa  310  5e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3828  band 7 protein  46.52 
 
 
379 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.549806  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1195  band 7 protein  45.38 
 
 
380 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3588  band 7 protein  47.09 
 
 
379 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.574317 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.99 
 
 
380 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0577091  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4422  band 7 protein  44.95 
 
 
382 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5433  band 7 protein  46.3 
 
 
379 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1471  band 7 protein  43.46 
 
 
383 aa  299  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4569  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.77 
 
 
375 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4260  SPFH domain-containing protein  43.77 
 
 
375 aa  289  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.246951  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3892  band 7 protein  38.77 
 
 
374 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0275  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.58 
 
 
383 aa  251  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660348  hitchhiker  0.0026961 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2638  band 7 protein  31.17 
 
 
499 aa  206  7e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.685729  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1491  band 7 protein  35.47 
 
 
368 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0171305  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0570  band 7 protein  29.35 
 
 
501 aa  199  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2837  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin-like  33.9 
 
 
368 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0012  band 7 protein  30 
 
 
297 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0515  band 7 protein  32.31 
 
 
256 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3885  band 7 protein  30.49 
 
 
290 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  30 
 
 
253 aa  90.9  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1052  band 7 protein  30.81 
 
 
298 aa  90.1  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2630  band 7 protein  27.46 
 
 
521 aa  89.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  29.94 
 
 
259 aa  88.2  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  29.65 
 
 
249 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2412  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.25 
 
 
270 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163549  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5265  band 7 protein  29.27 
 
 
290 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5594  band 7 protein  29.27 
 
 
290 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  28.82 
 
 
258 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0544  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.27 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048283  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  29.41 
 
 
248 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  31.03 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  31.03 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  28.8 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  31.03 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  28.37 
 
 
265 aa  84.7  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  27.54 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  29.07 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.03 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2766  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.84 
 
 
286 aa  84.7  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  28.74 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1233  Band 7 protein  27.54 
 
 
254 aa  84  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1713  band 7 protein  28.05 
 
 
290 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  27.06 
 
 
249 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  29.07 
 
 
251 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  28.24 
 
 
254 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  27.09 
 
 
263 aa  82.4  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.24 
 
 
257 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  25.35 
 
 
275 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.74 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  26.79 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03990  stomatin-like protein, putative  25.63 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.14 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  26.83 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1164  band 7 protein  27.54 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00105644  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  27.33 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  28.14 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  28.74 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  25.12 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4867  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.21 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03163  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13440)  25.12 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000111166  normal  0.837259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  28.82 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.82 
 
 
252 aa  79.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  28.74 
 
 
250 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  25.45 
 
 
255 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.11 
 
 
265 aa  79.7  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  29.32 
 
 
285 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.06 
 
 
261 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  26.32 
 
 
247 aa  79.3  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4950  band 7 protein  27.95 
 
 
278 aa  79  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493211  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2530  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.65 
 
 
257 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  28.31 
 
 
260 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3028  hypothetical protein  27.65 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.54 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.31 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  29.94 
 
 
281 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1506  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.71 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3200  band 7 protein  27.18 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2886  hypothetical protein  27.65 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1484  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.71 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.762715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.71 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  27.65 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  27.22 
 
 
274 aa  77  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.29 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61642  Stomatin-like protein 3  24.04 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  25.89 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  29.34 
 
 
281 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  27.71 
 
 
263 aa  77  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1815  band 7 protein  23.91 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.142899 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  27.65 
 
 
267 aa  76.6  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  28.83 
 
 
279 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1567  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.22 
 
 
251 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.189705  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5164  band 7 protein  26.97 
 
 
298 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1591  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.22 
 
 
251 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.653679  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1537  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.22 
 
 
251 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.473363  normal  0.284245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>