More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2837 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2837  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin-like  100 
 
 		 368 aa  736    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1471  band 7 protein  36.67 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1195  band 7 protein  37.95 
 
 		 380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5224  hypothetical protein  38.4 
 
 		 381 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60630  hypothetical protein  38.12 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1491  band 7 protein  35.56 
 
 		 368 aa  206  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0171305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0275  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.28 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660348  hitchhiker  0.0026961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4422  band 7 protein  35.96 
 
 		 382 aa  203  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3892  band 7 protein  37.14 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4670  band 7 protein  37.01 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3693  band 7 protein  37.01 
 
 		 379 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0676  band 7 protein  33.7 
 
 		 379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3828  band 7 protein  37.01 
 
 		 379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.549806  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0570  band 7 protein  35.09 
 
 		 501 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4569  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.72 
 
 		 375 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4641  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.73 
 
 		 512 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000031731  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4260  SPFH domain-containing protein  34.72 
 
 		 375 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.246951  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1571  band 7 protein  33.9 
 
 		 508 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.88 
 
 		 380 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0577091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3588  band 7 protein  36.44 
 
 		 379 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.574317 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5433  band 7 protein  35.88 
 
 		 379 aa  186  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2638  band 7 protein  36.6 
 
 		 499 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.685729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0515  band 7 protein  32.71 
 
 		 256 aa  123  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1052  band 7 protein  33.33 
 
 		 298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  32.71 
 
 		 265 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.44 
 
 		 267 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.44 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  35.44 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  34.63 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  34.63 
 
 		 281 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  33.17 
 
 		 255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5164  band 7 protein  28.42 
 
 		 298 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  32.71 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  31.55 
 
 		 259 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.17 
 
 		 261 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  30.84 
 
 		 261 aa  110  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.17 
 
 		 257 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  33.96 
 
 		 267 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  32.71 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  33.66 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2630  band 7 protein  30.54 
 
 		 521 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  32.69 
 
 		 351 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.19 
 
 		 270 aa  105  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  31.94 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  32.52 
 
 		 253 aa  104  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  27.91 
 
 		 295 aa  104  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  32.16 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  32.27 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  32.27 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  30.43 
 
 		 261 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.27 
 
 		 248 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.47 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0018  band 7 protein  32.54 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  32.37 
 
 		 251 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  32.16 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  28.04 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  32.51 
 
 		 248 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  31.28 
 
 		 254 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  30.62 
 
 		 249 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  31.88 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  30.29 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.16 
 
 		 261 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  30.43 
 
 		 252 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.02 
 
 		 278 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4950  band 7 protein  33.82 
 
 		 278 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493211  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  31.73 
 
 		 284 aa  99.8  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  31.4 
 
 		 252 aa  99.4  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1071  band 7 protein  32.09 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.33 
 
 		 264 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  28.99 
 
 		 256 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.88 
 
 		 257 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0620  band 7 protein  33.17 
 
 		 261 aa  99  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  31.88 
 
 		 257 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  28.37 
 
 		 261 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  31.88 
 
 		 257 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  30.56 
 
 		 285 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.35 
 
 		 270 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2150  band 7 protein  30.92 
 
 		 259 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  31.88 
 
 		 257 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.66 
 
 		 259 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03163  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13440)  27.23 
 
 		 344 aa  97.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000111166  normal  0.837259 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.81 
 
 		 252 aa  97.8  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1741  SPFH domain, Band 7 family protein  32.52 
 
 		 291 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.011683 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  30.65 
 
 		 267 aa  97.1  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.63 
 
 		 310 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  31.6 
 
 		 257 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.6 
 
 		 257 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 270 aa  97.1  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  27.54 
 
 		 274 aa  97.1  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  31.6 
 
 		 257 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1506  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.63 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1484  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.63 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.762715  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  29.47 
 
 		 252 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1233  Band 7 protein  29.44 
 
 		 254 aa  96.7  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2659  band 7 protein  31.31 
 
 		 266 aa  96.3  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37049  normal  0.0645118 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4388  band 7 protein  30.92 
 
 		 257 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.72 
 
 		 257 aa  96.3  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.47 
 
 		 251 aa  96.3  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0748  band 7 protein  29.47 
 
 		 252 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421043 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  29.72 
 
 		 257 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>