More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1052 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1052  band 7 protein  100 
 
 
298 aa  597  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5164  band 7 protein  62.41 
 
 
298 aa  357  9e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2837  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin-like  33.33 
 
 
368 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2638  band 7 protein  33.52 
 
 
499 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.685729  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1491  band 7 protein  34.73 
 
 
368 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0171305  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0570  band 7 protein  34.09 
 
 
501 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3892  band 7 protein  32.37 
 
 
374 aa  99  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1471  band 7 protein  32.95 
 
 
383 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5433  band 7 protein  32.56 
 
 
379 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2759  band 7 protein  26.98 
 
 
406 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84305  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3588  band 7 protein  33.33 
 
 
379 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.574317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2414  band 7 protein  25.21 
 
 
446 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4641  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.26 
 
 
512 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000031731  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3126  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.54 
 
 
392 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3137  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.54 
 
 
392 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3653  band 7 protein  25.7 
 
 
403 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3187  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.54 
 
 
392 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3828  band 7 protein  31.98 
 
 
379 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.549806  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1571  band 7 protein  30.81 
 
 
508 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4670  band 7 protein  31.98 
 
 
379 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3693  band 7 protein  31.98 
 
 
379 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11517  hypothetical protein  26.4 
 
 
381 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.52 
 
 
380 aa  89  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0577091  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4422  band 7 protein  28.98 
 
 
382 aa  89  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5224  hypothetical protein  30.3 
 
 
381 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1195  band 7 protein  28.48 
 
 
380 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0515  band 7 protein  27.41 
 
 
256 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  25.2 
 
 
473 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.44 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.44 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2630  band 7 protein  31.76 
 
 
521 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60630  hypothetical protein  29.7 
 
 
381 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  24.3 
 
 
402 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0275  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.27 
 
 
383 aa  86.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660348  hitchhiker  0.0026961 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4569  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.3 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4541  band 7 protein  26.82 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4260  SPFH domain-containing protein  30.3 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.246951  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0676  band 7 protein  29.41 
 
 
379 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0691  band 7 protein  25.27 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  26.36 
 
 
331 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  29.35 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  29.56 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.36 
 
 
325 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  23.35 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0862  band 7 protein  25.91 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  24 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  23.93 
 
 
456 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.54 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  24 
 
 
305 aa  79.7  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.62 
 
 
316 aa  79.3  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  25.45 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  25 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  22.67 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  29.38 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  29.38 
 
 
318 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  28.77 
 
 
304 aa  77  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  28.35 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  27.23 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  27.4 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.21 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  23.5 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  29.89 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1091  band 7 protein  27.31 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.6 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1880  band 7 protein  28.49 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126513  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.24 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  23.93 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0769  band 7 protein  26.73 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.953295  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  25.45 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  26.94 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  24.36 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  24.64 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  24.08 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.77 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  23.08 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.21 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.21 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  23.21 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  23.21 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.21 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37859  predicted protein  25.19 
 
 
348 aa  72.4  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370877  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  25.57 
 
 
346 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  23.21 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  23.21 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06901  Band 7 protein  29.95 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  24.24 
 
 
359 aa  72.4  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  22.78 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  25.58 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  26.15 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  22.78 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.12 
 
 
376 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02741  hypothetical protein  26.79 
 
 
312 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18370  SPFH domain, Band 7 family protein  26.22 
 
 
416 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.848038  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  24.03 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2412  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.2 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163549  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  28.18 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3305  band 7 protein  25.11 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366608  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1952  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.96 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.664065  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  24.46 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  24.46 
 
 
321 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>