More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1195 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1195  band 7 protein  100 
 
 		 380 aa  760    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5224  hypothetical protein  84.78 
 
 		 381 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60630  hypothetical protein  83.99 
 
 		 381 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4670  band 7 protein  67.64 
 
 		 379 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3693  band 7 protein  67.64 
 
 		 379 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3828  band 7 protein  67.65 
 
 		 379 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.549806  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  66.49 
 
 		 380 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0577091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3588  band 7 protein  65.44 
 
 		 379 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.574317 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5433  band 7 protein  65.17 
 
 		 379 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4422  band 7 protein  60.64 
 
 		 382 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1471  band 7 protein  59.21 
 
 		 383 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0676  band 7 protein  59.89 
 
 		 379 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4260  SPFH domain-containing protein  56.65 
 
 		 375 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.246951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4569  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.38 
 
 		 375 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0275  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.97 
 
 		 383 aa  310  4e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660348  hitchhiker  0.0026961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1571  band 7 protein  45.38 
 
 		 508 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4641  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.3 
 
 		 512 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000031731  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3892  band 7 protein  42.26 
 
 		 374 aa  295  6e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0012  band 7 protein  41.52 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2837  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin-like  37.95 
 
 		 368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1491  band 7 protein  36.39 
 
 		 368 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0171305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0570  band 7 protein  33.87 
 
 		 501 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2638  band 7 protein  33.05 
 
 		 499 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.685729  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2630  band 7 protein  26.43 
 
 		 521 aa  106  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5164  band 7 protein  31.58 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0515  band 7 protein  29.61 
 
 		 256 aa  94  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  31.08 
 
 		 258 aa  90.1  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  30.54 
 
 		 261 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1052  band 7 protein  28.48 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  29.94 
 
 		 259 aa  86.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  31.28 
 
 		 259 aa  86.3  7e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  29.68 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.18 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.16 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  30 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.73 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  30.17 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  29.05 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1233  Band 7 protein  28.41 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.17 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  30.14 
 
 		 281 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  30.72 
 
 		 274 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  30.11 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  29.92 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  30.94 
 
 		 258 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  29.41 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  30.59 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  28.98 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.56 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2191  band 7 protein  29.94 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  30.56 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  30.56 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2530  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.46 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  29.41 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1164  band 7 protein  28.41 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00105644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2659  band 7 protein  27.66 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37049  normal  0.0645118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  29.05 
 
 		 249 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  30.99 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  29.34 
 
 		 263 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  30 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  28.74 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.24 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  30.72 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  27.93 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  29.94 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  28.42 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.42 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  26.7 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  28.14 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.82 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  27.61 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  28.41 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0018  band 7 protein  31.41 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3885  band 7 protein  27.55 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3200  band 7 protein  26.7 
 
 		 278 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1071  band 7 protein  29.34 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  25.67 
 
 		 298 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2766  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.37 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.82 
 
 		 278 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3399  band 7 protein  28.14 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  28.41 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.41 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  28.98 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  27.54 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1643  band 7 protein  27.84 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182156  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  27.27 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.81 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.98 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  28.98 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.98 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  28.98 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  28.98 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.92 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  28.98 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  28.98 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  27.27 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  28.98 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  26.67 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  30.21 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>