More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0275 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0275  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 		 383 aa  766    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660348  hitchhiker  0.0026961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60630  hypothetical protein  44.97 
 
 		 381 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1195  band 7 protein  44.97 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5224  hypothetical protein  44.44 
 
 		 381 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1471  band 7 protein  45.78 
 
 		 383 aa  323  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0676  band 7 protein  43.65 
 
 		 379 aa  314  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4670  band 7 protein  44.83 
 
 		 379 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3693  band 7 protein  44.83 
 
 		 379 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3828  band 7 protein  44.68 
 
 		 379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.549806  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3588  band 7 protein  44.03 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.574317 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.62 
 
 		 380 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0577091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4422  band 7 protein  43.6 
 
 		 382 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5433  band 7 protein  43.77 
 
 		 379 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3892  band 7 protein  39.84 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4641  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.48 
 
 		 512 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000031731  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1571  band 7 protein  40.58 
 
 		 508 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4260  SPFH domain-containing protein  42.22 
 
 		 375 aa  265  8e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.246951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4569  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.95 
 
 		 375 aa  262  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2837  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin-like  36.52 
 
 		 368 aa  222  8e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0570  band 7 protein  35.2 
 
 		 501 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1491  band 7 protein  34.48 
 
 		 368 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0171305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2638  band 7 protein  34.16 
 
 		 499 aa  189  8e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.685729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0012  band 7 protein  29.66 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2630  band 7 protein  29.75 
 
 		 521 aa  123  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0515  band 7 protein  33.85 
 
 		 256 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  32.95 
 
 		 259 aa  106  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  30.48 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  31.31 
 
 		 265 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.82 
 
 		 267 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.25 
 
 		 267 aa  100  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  31.25 
 
 		 267 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5164  band 7 protein  26.32 
 
 		 298 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  29.63 
 
 		 261 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  31.64 
 
 		 253 aa  97.4  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  31.82 
 
 		 290 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  32.77 
 
 		 248 aa  96.7  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1233  Band 7 protein  31.07 
 
 		 254 aa  95.9  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  34.15 
 
 		 249 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  29.26 
 
 		 251 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  30.85 
 
 		 263 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  32.39 
 
 		 281 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  30.37 
 
 		 281 aa  94  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  30.51 
 
 		 248 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  29.59 
 
 		 265 aa  93.2  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  28.66 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  30.73 
 
 		 258 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  34.09 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  28.98 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2766  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.55 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.43 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  25.97 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  30.69 
 
 		 254 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  27.37 
 
 		 261 aa  92  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1164  band 7 protein  31.64 
 
 		 263 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00105644  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0018  band 7 protein  32.24 
 
 		 251 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.31 
 
 		 257 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.93 
 
 		 270 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  28.95 
 
 		 255 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  29.76 
 
 		 315 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  32.74 
 
 		 274 aa  91.3  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  28.04 
 
 		 259 aa  90.5  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  28.98 
 
 		 275 aa  90.5  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.63 
 
 		 261 aa  90.1  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  28.92 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  30.12 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  28.83 
 
 		 250 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  27.84 
 
 		 259 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  27.84 
 
 		 259 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.84 
 
 		 259 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3399  band 7 protein  27.46 
 
 		 279 aa  87  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  29.21 
 
 		 284 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.11 
 
 		 270 aa  86.3  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1052  band 7 protein  27.27 
 
 		 298 aa  86.3  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.98 
 
 		 248 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2412  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.55 
 
 		 270 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163549  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4950  band 7 protein  31.03 
 
 		 278 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493211  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  28.98 
 
 		 253 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0748  band 7 protein  28.41 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421043 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  28.41 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.41 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  27.27 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  28.98 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0526  membrane protease family, stomatin/prohibitin homolog  29.31 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.712597  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1660  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.31 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.242183  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2150  band 7 protein  28.98 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  28.57 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2530  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.72 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.41 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  31.31 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  28.41 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  28.74 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.17 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3547  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.45 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.105292  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0991  band 7 protein  30.06 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  28.98 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1024  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.11 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3885  band 7 protein  26.7 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0802  putative stomatin-like transmembrane protein  27.84 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.71 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  27.27 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.551636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>