More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0570 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0570  band 7 protein  100 
 
 		 501 aa  1018    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1491  band 7 protein  52.73 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0171305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2638  band 7 protein  37.1 
 
 		 499 aa  290  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.685729  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4641  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.63 
 
 		 512 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000031731  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1471  band 7 protein  34.32 
 
 		 383 aa  203  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0676  band 7 protein  35.05 
 
 		 379 aa  202  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1571  band 7 protein  29.35 
 
 		 508 aa  199  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5224  hypothetical protein  35.97 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2837  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin-like  35.09 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.5 
 
 		 380 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0577091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5433  band 7 protein  37.13 
 
 		 379 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3588  band 7 protein  37.5 
 
 		 379 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.574317 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60630  hypothetical protein  35.23 
 
 		 381 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4422  band 7 protein  33.79 
 
 		 382 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4670  band 7 protein  37.5 
 
 		 379 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3693  band 7 protein  37.5 
 
 		 379 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3828  band 7 protein  37.5 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.549806  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3892  band 7 protein  33.51 
 
 		 374 aa  187  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1195  band 7 protein  33.87 
 
 		 380 aa  186  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0275  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.2 
 
 		 383 aa  182  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660348  hitchhiker  0.0026961 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4260  SPFH domain-containing protein  35.91 
 
 		 375 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.246951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4569  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.71 
 
 		 375 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2630  band 7 protein  29.2 
 
 		 521 aa  169  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1052  band 7 protein  34.09 
 
 		 298 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0515  band 7 protein  32.68 
 
 		 256 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5164  band 7 protein  31.69 
 
 		 298 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1525  band 7 protein  26.11 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0012  band 7 protein  22.37 
 
 		 297 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2375  band 7 protein  25.21 
 
 		 334 aa  75.1  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  normal  0.805333 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  26.07 
 
 		 298 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  23.72 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  23.04 
 
 		 290 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  25.13 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  24.17 
 
 		 281 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  27.71 
 
 		 304 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1784  band 7 protein  25.76 
 
 		 276 aa  65.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  24.17 
 
 		 281 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  23.33 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  23.65 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  27.47 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  27.47 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  23.15 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1870  band 7 protein  24.79 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0180116 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  23.58 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  22.82 
 
 		 256 aa  63.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  25.6 
 
 		 268 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.19 
 
 		 268 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1623  band 7 protein  26.19 
 
 		 268 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.11 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0290  band 7 protein  26.19 
 
 		 268 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0917443  normal  0.201175 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1031  band 7/Mec-2 family protein  28.43 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.525956  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  23.11 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1525  band 7/Mec-2 family protein  26.9 
 
 		 304 aa  62  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  25.22 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.64 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0769  band 7 protein  28.22 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.953295  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  22.27 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  24.87 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2800  band 7 protein  26.89 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  22.91 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  25.11 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.3 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  22.12 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28570  SPFH domain, Band 7 family protein  25.52 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  26.42 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.33 
 
 		 265 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.85 
 
 		 312 aa  59.7  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  26.51 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  24.31 
 
 		 384 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  27.27 
 
 		 267 aa  59.3  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.14 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  33.61 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26530  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  26.73 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.149484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  22.33 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  22.97 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  25.64 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  25.64 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.29 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0900  HflC protein  26.42 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.219855  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  28.22 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  25.15 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0544  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.93 
 
 		 290 aa  57  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1233  Band 7 protein  23.53 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  19.8 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  22.06 
 
 		 284 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2388  band 7 protein  24.1 
 
 		 323 aa  56.6  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.791124  normal  0.159576 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  22.49 
 
 		 249 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2641  band 7 protein  27.61 
 
 		 409 aa  56.6  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  27.56 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01652  inner membrane protein  26.92 
 
 		 321 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0620  band 7 protein  27.08 
 
 		 261 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.9 
 
 		 345 aa  56.6  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  20.98 
 
 		 275 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  25.6 
 
 		 307 aa  55.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0654  band 7 protein  22.28 
 
 		 311 aa  55.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.317674  normal  0.0372256 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  21.92 
 
 		 295 aa  55.8  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  21.23 
 
 		 252 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  21.89 
 
 		 254 aa  55.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  21.53 
 
 		 248 aa  55.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  21.19 
 
 		 252 aa  55.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>