228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1525 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1525  band 7 protein  100 
 
 		 234 aa  448  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0515  band 7 protein  30.3 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2837  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin-like  33.5 
 
 		 368 aa  95.1  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1471  band 7 protein  29.5 
 
 		 383 aa  89  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4569  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31 
 
 		 375 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4260  SPFH domain-containing protein  31 
 
 		 375 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.246951  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0570  band 7 protein  26.11 
 
 		 501 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60630  hypothetical protein  30.73 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3588  band 7 protein  31 
 
 		 379 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.574317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  31.22 
 
 		 290 aa  82  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1571  band 7 protein  28.35 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0275  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.4 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.660348  hitchhiker  0.0026961 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5433  band 7 protein  30 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.68 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0577091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  29.19 
 
 		 259 aa  79.3  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5224  hypothetical protein  32.14 
 
 		 381 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559418  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4670  band 7 protein  30.11 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3693  band 7 protein  30.11 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  31.46 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3828  band 7 protein  30.11 
 
 		 379 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.549806  normal  0.391898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0676  band 7 protein  30.61 
 
 		 379 aa  78.6  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1195  band 7 protein  30.16 
 
 		 380 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4422  band 7 protein  28 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4641  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.55 
 
 		 512 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000031731  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2638  band 7 protein  24.02 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.685729  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  30.99 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3892  band 7 protein  32.05 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  29.19 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  31.02 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  29.76 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1491  band 7 protein  27.54 
 
 		 368 aa  75.1  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0171305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  29.19 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  27.09 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  29.8 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  28.23 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.11 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  31.63 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.64 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  28.17 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  29.11 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.23 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  28.71 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  26.29 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  29.19 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  28.17 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  28.23 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3200  band 7 protein  26.83 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  27.69 
 
 		 351 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  27.75 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28570  SPFH domain, Band 7 family protein  33.84 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1233  Band 7 protein  28.17 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.75 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.75 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1815  band 7 protein  29.9 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.142899 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.67 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1740  SPFH domain, Band 7 family protein  28.72 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0109204 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  25.26 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  29.02 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3381  band 7 protein  26.56 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4950  band 7 protein  33.5 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493211  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  27.78 
 
 		 249 aa  62  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.34 
 
 		 259 aa  62  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2440  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.19 
 
 		 270 aa  62  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169483  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  25.85 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  27.8 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  27.32 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  27.8 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  24.88 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0654  band 7 protein  28.23 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.317674  normal  0.0372256 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.09 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  27.8 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  27.8 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.8 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  28.43 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.14 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  26.98 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0018  band 7 protein  30.15 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  28.3 
 
 		 308 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1164  band 7 protein  27.18 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00105644  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  26.89 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.79 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  27.27 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3399  band 7 protein  27.57 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.85 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.78 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  25.37 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  26.29 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  25.85 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  26.8 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1870  band 7 protein  28.43 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0180116 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  30.15 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  26.8 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.23 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1623  band 7 protein  27.65 
 
 		 268 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1806  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.32 
 
 		 256 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175938  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2150  band 7 protein  29.13 
 
 		 259 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  28.23 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  28.23 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2412  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.36 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163549  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>