More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3491 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 283 aa  567  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.69 
 
 		 272 aa  271  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.47 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0151255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.71 
 
 		 272 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1123  ABC transporter, permease protein  49.81 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.33 
 
 		 272 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.71 
 
 		 271 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.57 
 
 		 272 aa  261  8e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.690729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4239  ABC transporter, permease protein  51.71 
 
 		 271 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1342  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  50.95 
 
 		 271 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3973  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.81 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.71 
 
 		 274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.605139  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.76 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.24 
 
 		 271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.33 
 
 		 271 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108142  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.6 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.01 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.809849 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.01 
 
 		 272 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.504609  normal  0.500913 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2498  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  47.57 
 
 		 272 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.33 
 
 		 271 aa  239  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.04 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0741  ABC transporter permease  47.91 
 
 		 273 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.21 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.09 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 		 283 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  34.01 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  34.01 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  34.01 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  32.16 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  30.61 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 		 257 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.63 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  28.8 
 
 		 256 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  31.12 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  31.12 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  31.63 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  31.63 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  31.12 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  30.73 
 
 		 250 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  30 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  31.12 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 		 279 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  31.12 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  28.95 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 		 279 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  28.95 
 
 		 274 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 		 257 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.67 
 
 		 266 aa  99.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.88 
 
 		 286 aa  99.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.453695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  28.95 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  31.12 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.73 
 
 		 267 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  31.12 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4887  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.82 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123695  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  28.36 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  30.88 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 		 253 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  29.74 
 
 		 253 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  30.85 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 		 256 aa  95.9  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 		 274 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  29.47 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.99 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 		 320 aa  92.8  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 259 aa  92  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 		 288 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1673  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2132  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  31.12 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.12 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0380  putative nitrate transmembrane ABC transporter protein  29.17 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.931268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1542  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  30.85 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1503  taurine ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  32.31 
 
 		 274 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0257  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.69 
 
 		 283 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0236  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  29.69 
 
 		 283 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  28.08 
 
 		 263 aa  89.4  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  33.16 
 
 		 274 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.33 
 
 		 284 aa  89  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.1 
 
 		 275 aa  88.6  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.142025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1470  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.66 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>