More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3975 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 271 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4239  ABC transporter, permease protein  71.22 
 
 		 271 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3973  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  70.85 
 
 		 271 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1342  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  69.14 
 
 		 271 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.48 
 
 		 271 aa  371  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108142  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.31 
 
 		 271 aa  328  6e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1123  ABC transporter, permease protein  59.77 
 
 		 271 aa  321  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.15 
 
 		 274 aa  320  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.605139  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.31 
 
 		 271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.67 
 
 		 272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.15 
 
 		 270 aa  312  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.48 
 
 		 273 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.67 
 
 		 272 aa  309  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.83 
 
 		 272 aa  309  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0151255 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.3 
 
 		 272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.36 
 
 		 272 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.809849 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.6 
 
 		 272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.504609  normal  0.500913 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.9 
 
 		 272 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.690729  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2498  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  54.31 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0741  ABC transporter permease  54.48 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.99 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.59 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.71 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.13 
 
 		 272 aa  245  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.41 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 		 259 aa  105  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.63 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  29.95 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  29.95 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  29.95 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 		 273 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  31 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4887  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.04 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  33.33 
 
 		 272 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  34.34 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  33.85 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.12 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.51 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 		 283 aa  99  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 		 276 aa  99  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 		 273 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 		 273 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  32.39 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.2 
 
 		 256 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  32.39 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.51 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  32.39 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 286 aa  96.3  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.91 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 		 267 aa  95.9  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  32.5 
 
 		 275 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  32.5 
 
 		 275 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  32.5 
 
 		 275 aa  95.5  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.7 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 		 265 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 		 302 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 		 265 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  32 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 		 265 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.12 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1684  ABC transporter permease  31.68 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  28.63 
 
 		 264 aa  93.6  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  31.98 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.05 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.75 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00127239  hitchhiker  0.00240392 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 		 320 aa  92.8  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19570  ABC transporter permease  31.19 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  28.44 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  28.95 
 
 		 274 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.77 
 
 		 294 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  28.95 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.19 
 
 		 284 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.78 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.7 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.02 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 		 282 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1556  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.05 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  27.31 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0620  taurine transport system permease protein TauC  26.82 
 
 		 245 aa  91.3  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00071484  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  34.67 
 
 		 275 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 		 252 aa  90.1  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.75 
 
 		 276 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.936191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2979  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.43 
 
 		 296 aa  89.4  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  28.77 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>