More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2184 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 272 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.01 
 
 		 272 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  90.81 
 
 		 272 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.48 
 
 		 270 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.92 
 
 		 272 aa  354  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.809849 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.17 
 
 		 272 aa  351  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.504609  normal  0.500913 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.87 
 
 		 272 aa  342  4e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0151255 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.02 
 
 		 273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2498  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  64.53 
 
 		 272 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.45 
 
 		 272 aa  318  6e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.690729  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4239  ABC transporter, permease protein  61.62 
 
 		 271 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3973  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  61.25 
 
 		 271 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1342  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  60.9 
 
 		 271 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0741  ABC transporter permease  59.85 
 
 		 273 aa  308  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.3 
 
 		 274 aa  305  7e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.605139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1123  ABC transporter, permease protein  55.85 
 
 		 271 aa  299  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.67 
 
 		 271 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.93 
 
 		 271 aa  292  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108142  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.09 
 
 		 272 aa  286  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.36 
 
 		 271 aa  282  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.2 
 
 		 271 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.23 
 
 		 270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.56 
 
 		 271 aa  269  4e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.71 
 
 		 283 aa  255  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  33.64 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  35.86 
 
 		 284 aa  118  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  35.86 
 
 		 284 aa  118  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  35.86 
 
 		 284 aa  118  9e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 		 283 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.17 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  31.56 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  34.01 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  34.34 
 
 		 285 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  34.39 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  35.5 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 		 279 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 		 257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  36.32 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  36.32 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  36.32 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.5 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  36.32 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  36.32 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  36.32 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  34.39 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  36.82 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  35.82 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4887  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.76 
 
 		 296 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  32.52 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  32.52 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  33.81 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1488  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.97 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106569  normal  0.790334 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  30.09 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.09 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.04 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.14 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.16 
 
 		 257 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369486  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 		 284 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.67 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.35 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1556  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.64 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  31.61 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  27.43 
 
 		 274 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  27.43 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3295  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.82 
 
 		 279 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2979  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.23 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  33.16 
 
 		 282 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.78 
 
 		 264 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  27.43 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.2 
 
 		 315 aa  92.4  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1503  taurine ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 		 288 aa  92  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2719  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.12 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  29.24 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.15 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.33 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.5 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7166  taurine uptake ABC transporter permease protein  33.86 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>