More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0611 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 271 aa  515  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.98 
 
 		 272 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.55 
 
 		 272 aa  306  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.809849 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.18 
 
 		 272 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.504609  normal  0.500913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.11 
 
 		 272 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.36 
 
 		 272 aa  299  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.72 
 
 		 270 aa  294  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.23 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2498  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  56.55 
 
 		 272 aa  289  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.09 
 
 		 272 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.690729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1342  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.61 
 
 		 271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0741  ABC transporter permease  59.04 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.9 
 
 		 272 aa  280  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0151255 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3973  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.28 
 
 		 271 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1123  ABC transporter, permease protein  54.14 
 
 		 271 aa  278  9e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4239  ABC transporter, permease protein  53.16 
 
 		 271 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.18 
 
 		 274 aa  272  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.605139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.79 
 
 		 271 aa  268  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108142  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.38 
 
 		 273 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.14 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.16 
 
 		 271 aa  255  6e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.53 
 
 		 271 aa  246  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.65 
 
 		 270 aa  241  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.21 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 		 283 aa  116  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.93 
 
 		 275 aa  115  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  30.22 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 		 276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.69 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 		 255 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  34.69 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  34.69 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  34.69 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  34.16 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  34.25 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.87 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.7 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 		 274 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 		 279 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  35.11 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  32.35 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4060  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.58 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  35.35 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.17 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  32.35 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.17 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  36.18 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  36.18 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  35.68 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 		 274 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  36.18 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  35.68 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  35.68 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  31.43 
 
 		 274 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 		 294 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.69 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4887  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.54 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123695  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  36.18 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  35.68 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.89 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159688 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2719  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.17 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.47 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.83 
 
 		 266 aa  96.7  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  34.74 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 		 252 aa  95.5  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1188  taurine ABC transporter, permease protein  32.46 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0612406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1848  ABC transporter permease  33.19 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.19 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.74 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.66 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.142025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 		 291 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  26.64 
 
 		 273 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1503  taurine ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 288 aa  92  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.17 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 		 272 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1982  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.66 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.187248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0326  nitrate transport permease  28.18 
 
 		 295 aa  91.3  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>