More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2498 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2498  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  100 
 
 		 272 aa  524  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.25 
 
 		 272 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.809849 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  80.51 
 
 		 272 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.504609  normal  0.500913 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.15 
 
 		 270 aa  357  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.91 
 
 		 272 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.53 
 
 		 272 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.91 
 
 		 272 aa  329  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60 
 
 		 272 aa  321  8e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0151255 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4239  ABC transporter, permease protein  61.05 
 
 		 271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1123  ABC transporter, permease protein  56.88 
 
 		 271 aa  305  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3973  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.55 
 
 		 271 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1342  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.93 
 
 		 271 aa  299  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.44 
 
 		 273 aa  294  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0741  ABC transporter permease  59.62 
 
 		 273 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.6 
 
 		 272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.690729  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.55 
 
 		 274 aa  278  8e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.605139  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.2 
 
 		 271 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.55 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.81 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108142  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.31 
 
 		 271 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.04 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.63 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.84 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.57 
 
 		 283 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.5 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  30.39 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 		 285 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  30.94 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  30.39 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.71 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  31.71 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  33.82 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  33.82 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  33.82 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.5 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  33.33 
 
 		 279 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  37.31 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 		 275 aa  102  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  36.82 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  34.83 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  36.82 
 
 		 275 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  30.66 
 
 		 282 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.49 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  37.31 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 		 279 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  36.32 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  36.32 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  36.32 
 
 		 275 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 		 279 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  36.32 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 		 279 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 		 257 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1323  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.83 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0560082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  38.29 
 
 		 272 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 		 274 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  32.05 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  31 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  31 
 
 		 283 aa  95.5  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  31 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  31 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  31 
 
 		 283 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  37.27 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  31 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 		 277 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.22 
 
 		 282 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.27 
 
 		 286 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.453695  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185051 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0049  ABC taurine transporter, binding protein inner membrane component  32.57 
 
 		 330 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0656508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  31.22 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21990  ABC transporter, inner membrane permease component  31.28 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 		 296 aa  89  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159688 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.86 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0467  taurine ABC transporter, permease protein, putative  26.92 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.25 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0466  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.95 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000143494  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0406  putative taurine ABC transporter, permease protein  26.92 
 
 		 272 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 		 412 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0735  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  25.79 
 
 		 273 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.714635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  31.9 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 		 289 aa  87  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.142025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1503  taurine ABC transporter, permease protein  31.22 
 
 		 288 aa  86.3  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>