More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4239 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4239  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 271 aa  520  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3973  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  96.68 
 
 		 271 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1342  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  90.71 
 
 		 271 aa  478  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  82.29 
 
 		 271 aa  424  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108142  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.22 
 
 		 271 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.43 
 
 		 271 aa  359  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.06 
 
 		 271 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1123  ABC transporter, permease protein  62.03 
 
 		 271 aa  337  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.33 
 
 		 270 aa  325  6e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.99 
 
 		 272 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.62 
 
 		 272 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.07 
 
 		 273 aa  315  5e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.62 
 
 		 272 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.89 
 
 		 274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.605139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0741  ABC transporter permease  61.71 
 
 		 273 aa  310  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.05 
 
 		 272 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.504609  normal  0.500913 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.05 
 
 		 272 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.809849 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2498  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  61.05 
 
 		 272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.3 
 
 		 272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0151255 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.9 
 
 		 272 aa  279  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.690729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.87 
 
 		 270 aa  265  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.16 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.65 
 
 		 272 aa  258  5.0000000000000005e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.71 
 
 		 283 aa  250  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  37.69 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.23 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  38.69 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  38.69 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  38.69 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  38.69 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.7 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  40.2 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  40.59 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  40.1 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  40.1 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  38.69 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  38.69 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  38.69 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  39.6 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  40.59 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  35.59 
 
 		 272 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  35.59 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 283 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  33.65 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.76 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 283 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 283 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  33 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 283 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  33 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1210  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 		 320 aa  102  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.18 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  hitchhiker  0.00645779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.5 
 
 		 271 aa  99.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 		 286 aa  99  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.17 
 
 		 276 aa  99  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  31.42 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.854714  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2304  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.78 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.37818 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  31.11 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2324  nitrate ABC transporter, inner membrane subunit  35.42 
 
 		 293 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.38 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 253 aa  96.7  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3478  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 		 302 aa  96.7  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0528102 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  29.02 
 
 		 275 aa  95.5  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.09 
 
 		 288 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 		 280 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.03 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1556  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.79 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 		 264 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  31.78 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  31.78 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.6 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.612608  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 		 257 aa  92.8  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>