More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1888 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1888  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 273 aa  535  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2184  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.02 
 
 		 272 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.5 
 
 		 272 aa  334  9e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0151255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.12 
 
 		 272 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.470988  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.74 
 
 		 272 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1226  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.23 
 
 		 270 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.65 
 
 		 274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.605139  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3973  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  59.33 
 
 		 271 aa  315  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.219679  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4239  ABC transporter, permease protein  60.07 
 
 		 271 aa  315  5e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.09 
 
 		 272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.809849 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.33 
 
 		 272 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.504609  normal  0.500913 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1123  ABC transporter, permease protein  57.09 
 
 		 271 aa  310  2e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1342  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  58.96 
 
 		 271 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.59 
 
 		 271 aa  308  8e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108142  normal  0.0447378 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3975  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.48 
 
 		 271 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0741  ABC transporter permease  56.3 
 
 		 273 aa  293  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2498  ABC transporter membrane spanning protein (aliphatic sulphonate)  54.44 
 
 		 272 aa  294  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.476701  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.95 
 
 		 272 aa  293  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.690729  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.82 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.84 
 
 		 270 aa  280  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.61 
 
 		 272 aa  267  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.82 
 
 		 271 aa  268  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.38 
 
 		 271 aa  256  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0926261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.76 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 		 285 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  34.87 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  34.87 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  34.87 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  34.87 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.2 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  39.09 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  39.09 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 		 279 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  38.58 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  38.27 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  38.27 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  38.27 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  35.5 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.76 
 
 		 275 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  38.58 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  38.58 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  35.6 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  29.39 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.395379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 		 279 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0355  putative ABC aliphatic sulfonates transporter, permease subunit  31.23 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2630  sulfonate ABC transporter, permease protein, putative  32.12 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.312135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1556  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.5 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3413  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0409101  normal  0.884011 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  35.6 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3869  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 		 274 aa  99.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2220  taurine ABC transporter, permease protein  31.53 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215273  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.306936 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  31.53 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2748  sulfonate/taurine ABC transporter permease  26.79 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947189  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  31.53 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  31.53 
 
 		 253 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 		 275 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2133  taurine ABC transporter, permease protein  31.53 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0697  taurine ABC transporter, permease protein  31.53 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3060  taurine ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0244271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.14 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.106321 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3058  taurine ABC transporter, permease protein  29.07 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0802  taurine ABC transporter, permease protein  31.53 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1736  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.440066  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 		 265 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6203  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.17 
 
 		 284 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.780444  normal  0.280504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.44 
 
 		 283 aa  95.5  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.4 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.293544  normal  0.0445843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.8 
 
 		 272 aa  95.5  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.334714  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2152  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.34 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4887  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.1 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.14 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.80309  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 		 254 aa  94.7  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.46 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0722896  normal  0.022026 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1453  alkanesulfonate transporter permease subunit  29.64 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3299  putative sulfonate ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 		 286 aa  94  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201269  normal  0.262094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.37 
 
 		 273 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132759  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0887356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.46 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0233  ABC transporter, permease protein  29.76 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5005  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0761  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 		 412 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5412  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.35 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210037  hitchhiker  0.00191971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00127239  hitchhiker  0.00240392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27 
 
 		 264 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.050552  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7166  taurine uptake ABC transporter permease protein  35.04 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1031  sulfonate ABC transporter, permease protein  31.77 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>