164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2513 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2513  peptidase M50  100 
 
 
179 aa  357  4e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  35.67 
 
 
376 aa  68.9  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  31.55 
 
 
394 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  31.55 
 
 
368 aa  62  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  33.06 
 
 
372 aa  62  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4292  peptidase M50  37.38 
 
 
286 aa  61.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  31.58 
 
 
366 aa  60.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  28.14 
 
 
378 aa  60.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0832  peptidase M50  30.11 
 
 
370 aa  59.7  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  30.77 
 
 
364 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  29.38 
 
 
373 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  30.33 
 
 
375 aa  58.2  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5311  peptidase M50  30.46 
 
 
301 aa  58.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783881  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1497  peptidase M50  32.23 
 
 
372 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  32.54 
 
 
373 aa  57.8  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4565  stage IV sporulation protein FB  34.26 
 
 
286 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000384784  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  31.98 
 
 
412 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  27.59 
 
 
338 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  26.44 
 
 
337 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  26.44 
 
 
342 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0694  peptidase M50  31.4 
 
 
366 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0524  peptidase M50  29.94 
 
 
285 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.311607  hitchhiker  0.00535986 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4180  stage IV sporulation protein FB  31.82 
 
 
286 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  33.62 
 
 
393 aa  55.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  32.73 
 
 
370 aa  56.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  32.32 
 
 
397 aa  55.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4526  stage IV sporulation protein FB  31.82 
 
 
286 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.870935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  33.95 
 
 
373 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  28.75 
 
 
336 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0669  stage IV sporulation protein FB  33.33 
 
 
286 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000475668  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4191  stage IV sporulation protein FB  30.91 
 
 
286 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2354  peptidase M50  33.93 
 
 
386 aa  54.7  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4580  stage IV sporulation protein FB  34.26 
 
 
286 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000567867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  31.29 
 
 
413 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4538  stage IV sporulation protein FB  32.71 
 
 
286 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.214848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  31.19 
 
 
239 aa  54.3  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  38.68 
 
 
388 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4344  stage IV sporulation protein FB  31.82 
 
 
286 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4678  stage IV sporulation protein FB  31.82 
 
 
286 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0277771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2237  peptidase M50  33.91 
 
 
359 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.949585  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  40.74 
 
 
396 aa  53.9  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14160  peptidase M50  32.5 
 
 
272 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000034797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3161  peptidase M50  33.01 
 
 
286 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000495345  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  26.52 
 
 
384 aa  53.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  33.33 
 
 
395 aa  53.1  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  28.74 
 
 
400 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  34.71 
 
 
364 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1818  peptidase M50  34.33 
 
 
302 aa  52.8  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  38.1 
 
 
392 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  33.85 
 
 
390 aa  51.6  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11840  Zn-dependent protease  28.4 
 
 
375 aa  52  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0392218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  32.72 
 
 
373 aa  51.6  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  34.23 
 
 
377 aa  52  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  33.64 
 
 
380 aa  52  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0549  peptidase M50  39.81 
 
 
293 aa  51.6  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00818515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  34.75 
 
 
362 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  30.89 
 
 
415 aa  51.6  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  39.81 
 
 
373 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  29.55 
 
 
386 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  33.74 
 
 
374 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  33.74 
 
 
374 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1502  hypothetical protein  32.85 
 
 
365 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  31.65 
 
 
395 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1818  peptidase M50  30.43 
 
 
293 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000422753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2946  peptidase M50  35.34 
 
 
313 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000715843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  30.81 
 
 
370 aa  50.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1570  hypothetical protein  32.12 
 
 
365 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0569959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  32.48 
 
 
384 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  31.19 
 
 
343 aa  49.7  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3843  hypothetical protein  32.12 
 
 
365 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0912094  hitchhiker  0.00000000235959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  34.45 
 
 
376 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3329  peptidase M50  27.88 
 
 
290 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.014503  normal  0.780198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  32.7 
 
 
383 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  31.21 
 
 
381 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  28.05 
 
 
374 aa  48.9  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1355  hypothetical protein  31.39 
 
 
365 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  37.14 
 
 
431 aa  48.9  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  30.13 
 
 
390 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1329  membrane metalloprotease  31.39 
 
 
365 aa  48.5  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1465  hypothetical protein  31.39 
 
 
365 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1538  hypothetical protein  31.39 
 
 
365 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000573699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1370  peptidase M50  31.39 
 
 
365 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00911747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1608  hypothetical protein  31.39 
 
 
365 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  32.48 
 
 
286 aa  48.1  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  31.18 
 
 
405 aa  48.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3297  peptidase M50  32.74 
 
 
258 aa  48.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  36.19 
 
 
416 aa  47.8  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  26.78 
 
 
375 aa  47.8  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0558  peptidase M50  29.85 
 
 
372 aa  47.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.463996  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  32.11 
 
 
376 aa  47.8  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  30.63 
 
 
383 aa  47.8  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  33.04 
 
 
360 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1166  peptidase M50  31.85 
 
 
366 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2543  peptidase M50  33.98 
 
 
287 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000176554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1328  membrane metalloprotease  30.66 
 
 
365 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.826194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0147  peptidase M50  31.93 
 
 
698 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2539  peptidase M50  29.8 
 
 
293 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0160669  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  30.06 
 
 
381 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  29.23 
 
 
360 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>