246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0485 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0485  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 864 aa  1751    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0747681  normal  0.0698071 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1512  protein-P-II uridylyltransferase  29.31 
 
 		 906 aa  348  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1426  UTP-GlnB (protein PII) uridylyltransferase, GlnD  28.14 
 
 		 899 aa  332  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.918297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1820  protein-P-II uridylyltransferase, putative  28.12 
 
 		 902 aa  327  7e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.074397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1877  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.71 
 
 		 894 aa  319  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2384  metal dependent phosphohydrolase  27.86 
 
 		 898 aa  317  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0567  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.11 
 
 		 887 aa  317  6e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2333  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28.59 
 
 		 894 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1343  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.64 
 
 		 905 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0574  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  29.37 
 
 		 864 aa  308  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.342423  normal  0.895428 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2691  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  28 
 
 		 900 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.79049  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1411  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.07 
 
 		 924 aa  279  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2112  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 927 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0838808  normal  0.131108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1692  metal dependent phosphohydrolase  26.43 
 
 		 930 aa  270  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.427674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2253  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.38 
 
 		 930 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2164  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.26 
 
 		 930 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.191815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3539  PII uridylyl-transferase  27.52 
 
 		 936 aa  260  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2309  metal dependent phosphohydrolase  28.01 
 
 		 872 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.460476  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3602  PII uridylyl-transferase  25.68 
 
 		 931 aa  253  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2799  PII uridylyl-transferase  25.43 
 
 		 937 aa  244  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0284  PII uridylyl-transferase  26.57 
 
 		 969 aa  243  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.610069  normal  0.0372398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0116  PII uridylyl-transferase  25.72 
 
 		 933 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2185  PII uridylyl-transferase  25.14 
 
 		 936 aa  242  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00224079  normal  0.664857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0342  PII uridylyl-transferase  25.63 
 
 		 931 aa  240  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1147  PII uridylyl-transferase  24.54 
 
 		 1029 aa  238  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7648  PII uridylyl-transferase  25.21 
 
 		 931 aa  237  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.285774 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0382  PII uridylyl-transferase  25.2 
 
 		 928 aa  233  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.267202 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0335  PII uridylyl-transferase  25.2 
 
 		 928 aa  233  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3127  PII uridylyl-transferase  26.55 
 
 		 953 aa  233  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0414  PII uridylyl-transferase  25.15 
 
 		 928 aa  232  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.394312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0594  PII uridylyl-transferase  24.6 
 
 		 933 aa  230  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3543  PII uridylyl-transferase  24.35 
 
 		 935 aa  229  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.654766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0914  PII uridylyl-transferase  26.83 
 
 		 938 aa  228  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0032  PII uridylyl-transferase  25 
 
 		 932 aa  228  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.968292  normal  0.957944 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2787  PII uridylyl-transferase  26.16 
 
 		 935 aa  227  9e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565994  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0226  PII uridylyl-transferase  24.79 
 
 		 931 aa  224  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.952956  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0864  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  27.22 
 
 		 967 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.829416 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0806  protein-P-II uridylyltransferase  25.24 
 
 		 892 aa  224  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.389764  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1829  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 		 906 aa  223  9e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.570932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0469  PII uridylyl-transferase  26.58 
 
 		 930 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0882544 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0897  PII uridylyl-transferase  25.81 
 
 		 914 aa  222  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.88473 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3956  PII uridylyl-transferase  26.02 
 
 		 936 aa  222  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0133  PII uridylyl-transferase  24.79 
 
 		 925 aa  221  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.633689  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0300  PII uridylyl-transferase  26.78 
 
 		 989 aa  215  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.940535  normal  0.172702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0031  PII uridylyl-transferase  25.47 
 
 		 949 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000404003 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2602  PII uridylyl-transferase  24.7 
 
 		 900 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0446  PII uridylyl-transferase  25.8 
 
 		 893 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3055  PII uridylyl-transferase  25.06 
 
 		 899 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0157  PII uridylyl-transferase  24.73 
 
 		 934 aa  214  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1157  (Protein-PII) uridylyltransferase  24.88 
 
 		 899 aa  213  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0045  PII uridylyl-transferase  25.55 
 
 		 968 aa  212  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.893675 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1811  PII uridylyl-transferase  26.28 
 
 		 930 aa  212  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0458  PII uridylyl-transferase  26.28 
 
 		 930 aa  212  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0418586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1499  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.27 
 
 		 893 aa  211  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.179178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39010  PII uridylyl-transferase  24.85 
 
 		 899 aa  210  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0144  PII uridylyl-transferase  24.66 
 
 		 934 aa  209  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3046  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.74 
 
 		 833 aa  208  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0139  PII uridylyl-transferase  24.42 
 
 		 934 aa  206  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0424  PII uridylyl-transferase  24.94 
 
 		 941 aa  205  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0682  PII uridylyl-transferase  25.28 
 
 		 912 aa  204  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0030  PII uridylyl-transferase  25.52 
 
 		 968 aa  204  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4084  PII uridylyl-transferase  24.3 
 
 		 900 aa  204  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.822232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3155  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.98 
 
 		 916 aa  201  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620128  normal  0.567988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0561  PII uridylyl-transferase  25.59 
 
 		 891 aa  201  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113275  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1144  PII uridylyl-transferase  24.7 
 
 		 900 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.972072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2550  PII uridylyl-transferase  25.12 
 
 		 881 aa  200  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1589  PII uridylyl-transferase  24.46 
 
 		 900 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.590557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4033  PII uridylyl-transferase  24.76 
 
 		 912 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.23625  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2833  PII uridylyl-transferase  24.5 
 
 		 943 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4188  PII uridylyl-transferase  24.46 
 
 		 900 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1865  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.94 
 
 		 894 aa  198  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.678957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1043  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  26.92 
 
 		 862 aa  197  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030161 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0924  protein-P-II uridylyltransferase  26.92 
 
 		 862 aa  197  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2147  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  25.18 
 
 		 863 aa  195  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.112628  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1532  [protein-pII] uridylyltransferase  23.83 
 
 		 898 aa  193  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3792  PII uridylyl-transferase  24.97 
 
 		 892 aa  193  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.991129  hitchhiker  0.000938474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3101  PII uridylyl-transferase  24.03 
 
 		 885 aa  193  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429175  normal  0.244748 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1819  PII uridylyl-transferase  24.19 
 
 		 864 aa  193  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2180  PII uridylyl-transferase  25.27 
 
 		 858 aa  193  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234625  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1918  PII uridylyl-transferase  24.12 
 
 		 884 aa  191  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2005  UTP-GlnB uridylyltransferase, GlnD  24.32 
 
 		 937 aa  190  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.572781  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17040  PII uridylyl-transferase  23.75 
 
 		 900 aa  190  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0565  protein-P-II uridylyltransferase  25.33 
 
 		 877 aa  190  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.184337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1739  PII uridylyl-transferase  24.31 
 
 		 852 aa  190  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1099  PII uridylyl-transferase  24.21 
 
 		 900 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1340  PII uridylyl-transferase  23.54 
 
 		 862 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3167  PII uridylyl-transferase  25.18 
 
 		 893 aa  189  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1557  PII uridylyl-transferase  25.72 
 
 		 858 aa  188  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2585  PII uridylyl-transferase  25.72 
 
 		 858 aa  188  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1276  PII uridylyl-transferase  23.75 
 
 		 862 aa  188  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.111517  normal  0.077343 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1331  PII uridylyl-transferase  25.72 
 
 		 858 aa  188  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.118754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2059  PII uridylyl-transferase  25.72 
 
 		 858 aa  188  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.222746  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3252  PII uridylyl-transferase  25.72 
 
 		 858 aa  188  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.131607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2439  PII uridylyl-transferase  25.72 
 
 		 858 aa  188  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2496  PII uridylyl-transferase  25.72 
 
 		 858 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0815155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1481  PII uridylyl-transferase  23.75 
 
 		 900 aa  187  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.918327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1341  PII uridylyl-transferase  24.63 
 
 		 898 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0009  PII uridylyl-transferase  23.6 
 
 		 941 aa  187  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0169  PII uridylyl-transferase  24.24 
 
 		 890 aa  185  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0177  PII uridylyl-transferase  24.24 
 
 		 890 aa  185  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>