149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2267 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1238  acyltransferase family protein  72.87 
 
 		 619 aa  896    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1159  phospholipid/glycerol acyltransferase  72.22 
 
 		 633 aa  889    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1245  phospholipid/glycerol acyltransferase  58.63 
 
 		 591 aa  693    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975874  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1056  phospholipid/glycerol acyltransferase  72.87 
 
 		 629 aa  898    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.429554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  73.04 
 
 		 629 aa  900    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2267  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 		 579 aa  1205    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1060  phospholipid/glycerol acyltransferase  73.04 
 
 		 624 aa  899    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0991  acyltransferase family protein  64.52 
 
 		 586 aa  794    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  72.05 
 
 		 638 aa  891    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2792  phospholipid/glycerol acyltransferase  73.87 
 
 		 605 aa  890    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.418841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2810  phospholipid/glycerol acyltransferase  73 
 
 		 630 aa  887    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  72.05 
 
 		 638 aa  890    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.313645  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02090  acyltransferase family protein  58.2 
 
 		 583 aa  673    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.486339  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3347  phospholipid/glycerol acyltransferase  72.22 
 
 		 638 aa  890    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2645  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.91 
 
 		 569 aa  622  1e-177  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.221225 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3909  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.37 
 
 		 571 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0241  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.8 
 
 		 569 aa  566  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0321  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.96 
 
 		 568 aa  566  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4078  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.64 
 
 		 570 aa  567  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1871  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.05 
 
 		 571 aa  546  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.72 
 
 		 571 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2569  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.88 
 
 		 573 aa  546  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.64 
 
 		 576 aa  535  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1073  DNA polymerase III, alpha subunit  42.81 
 
 		 571 aa  538  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.475912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0842  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.15 
 
 		 568 aa  537  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0631  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.37 
 
 		 571 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0411  hemolysin  33.03 
 
 		 590 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0590  hypothetical protein  32.05 
 
 		 605 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.803828  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0834  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.59 
 
 		 583 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2307  putative hemolysin  32.09 
 
 		 607 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2481  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.9 
 
 		 626 aa  256  7e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176088 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0322  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.48 
 
 		 611 aa  240  5.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1504  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.04 
 
 		 597 aa  239  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000190561 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0042  hypothetical protein  29.27 
 
 		 586 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.715223  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02315  putative hemolysin  28.88 
 
 		 605 aa  237  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00835  hypothetical protein  29.66 
 
 		 587 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0833  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.94 
 
 		 600 aa  234  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336086  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0593  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.02 
 
 		 613 aa  229  9e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001630  putative hemolysin  28.84 
 
 		 582 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.39 
 
 		 616 aa  208  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.46 
 
 		 636 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0797  putative hemolysin  31.32 
 
 		 591 aa  190  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0583  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.55 
 
 		 584 aa  184  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.6 
 
 		 662 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1875  hemolysin  28.05 
 
 		 324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1876  hypothetical protein  28.88 
 
 		 275 aa  112  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2071  hypothetical protein  27.56 
 
 		 311 aa  92.4  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3211  phospholipid/glycerol acyltransferase  25 
 
 		 304 aa  89.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.38 
 
 		 292 aa  85.5  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3660  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.25 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3959  phospholipid/glycerol acyltransferase  25 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1761  putative acyltransferase  28.39 
 
 		 292 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346469  normal  0.939914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2339  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.56 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268322  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4054  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.02 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2932  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.27 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0206  hypothetical protein  26.98 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3082  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.27 
 
 		 303 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.941494  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2435  hypothetical protein  24.36 
 
 		 317 aa  69.3  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.335175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0693  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.24 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1983  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.24 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0516476  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0542  hypothetical protein  25.73 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2843  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.55 
 
 		 281 aa  66.6  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2080  phospholipid/glycerol acyltransferase  28 
 
 		 283 aa  66.2  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0102269  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  31.76 
 
 		 291 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2102  hypothetical protein  31.21 
 
 		 281 aa  62  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  35.65 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.13 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2886  putative hemolysin-like protein  29.65 
 
 		 265 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  27.87 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2719  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  26.57 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.290842 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0143  hypothetical protein  29.94 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  26.52 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_004310  BR0148  hypothetical protein  29.49 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  27.52 
 
 		 266 aa  57  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0418  hypothetical protein  35.92 
 
 		 291 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0028  hypothetical protein  32.61 
 
 		 296 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000147407 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0160  hypothetical protein  27.43 
 
 		 297 aa  56.2  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1138  hypothetical protein  30.67 
 
 		 280 aa  55.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.194098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.22 
 
 		 250 aa  53.9  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  29.41 
 
 		 271 aa  53.5  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  30.15 
 
 		 270 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0395  hypothetical protein  28.8 
 
 		 257 aa  53.5  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.15 
 
 		 270 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1196  putative hemolysin-like protein  30.15 
 
 		 268 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0329892  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  34.26 
 
 		 307 aa  52.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1221  putative hemolysin-like protein  30.15 
 
 		 268 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0314  hypothetical protein  25 
 
 		 321 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0699  hypothetical protein  31.29 
 
 		 315 aa  51.6  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1121  hypothetical protein  32.41 
 
 		 249 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1116  hypothetical protein  27.8 
 
 		 332 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  26.57 
 
 		 253 aa  50.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0412  hypothetical protein  28.26 
 
 		 337 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.666795 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  30.84 
 
 		 268 aa  50.8  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2028  hypothetical protein  30.58 
 
 		 282 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.131913  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0408  hypothetical protein  28.57 
 
 		 337 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4248  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.65 
 
 		 317 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.876702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4454  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.91 
 
 		 268 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0859563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1311  putative hemolysin-like protein  29.41 
 
 		 268 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309532  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0944  Putative hemolysin-like protein  21.82 
 
 		 288 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000783609  normal  0.05177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13043  hypothetical protein  31.48 
 
 		 246 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000906572  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>