47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1875 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1875  hemolysin  100 
 
 
324 aa  669    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1073  DNA polymerase III, alpha subunit  34.32 
 
 
571 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.475912 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1871  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.35 
 
 
571 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4078  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.67 
 
 
570 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.02 
 
 
629 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1060  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.02 
 
 
624 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1056  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.66 
 
 
629 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.429554  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2810  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.7 
 
 
630 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1238  acyltransferase family protein  29.96 
 
 
619 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.13 
 
 
576 aa  136  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3347  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.29 
 
 
638 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1159  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.29 
 
 
633 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.29 
 
 
638 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.29 
 
 
638 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.313645  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2481  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.7 
 
 
626 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.176088 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2267  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.05 
 
 
579 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103788  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0322  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.35 
 
 
611 aa  128  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2645  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.24 
 
 
569 aa  123  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.221225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2792  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.23 
 
 
605 aa  122  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.418841 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0991  acyltransferase family protein  30.26 
 
 
586 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1245  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.03 
 
 
591 aa  122  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975874  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1504  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.14 
 
 
597 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000190561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001630  putative hemolysin  29.26 
 
 
582 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0834  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.3 
 
 
583 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0833  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.51 
 
 
600 aa  116  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336086  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3909  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.12 
 
 
571 aa  116  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0593  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.39 
 
 
613 aa  115  8.999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0241  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.12 
 
 
569 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0321  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.35 
 
 
568 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0042  hypothetical protein  30.86 
 
 
586 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.715223  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02090  acyltransferase family protein  28.47 
 
 
583 aa  113  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.486339  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0411  hemolysin  29.5 
 
 
590 aa  109  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00835  hypothetical protein  27.21 
 
 
587 aa  109  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2307  putative hemolysin  29.81 
 
 
607 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0842  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.07 
 
 
568 aa  106  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02315  putative hemolysin  25.97 
 
 
605 aa  105  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0590  hypothetical protein  28.43 
 
 
605 aa  104  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.803828  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.16 
 
 
571 aa  103  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0631  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.29 
 
 
571 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0510575 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.3 
 
 
662 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0797  putative hemolysin  28.8 
 
 
591 aa  94  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.13 
 
 
616 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2569  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.47 
 
 
573 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0583  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.39 
 
 
584 aa  86.7  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.69 
 
 
636 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0395  hypothetical protein  22.41 
 
 
257 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0583  putative hemolysin-like protein  24.89 
 
 
320 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>