127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0797 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0797  putative hemolysin  100 
 
 
591 aa  1227    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0583  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.23 
 
 
584 aa  550  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2481  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.79 
 
 
626 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.176088 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001630  putative hemolysin  35.97 
 
 
582 aa  336  9e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1504  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.5 
 
 
597 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000190561 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0411  hemolysin  35.6 
 
 
590 aa  327  4.0000000000000003e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00835  hypothetical protein  35.12 
 
 
587 aa  318  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0042  hypothetical protein  35.32 
 
 
586 aa  317  6e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.715223  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0590  hypothetical protein  33.99 
 
 
605 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.803828  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2307  putative hemolysin  32.57 
 
 
607 aa  303  8.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0593  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.27 
 
 
613 aa  290  4e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.43 
 
 
636 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.13 
 
 
662 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0834  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.83 
 
 
583 aa  272  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02315  putative hemolysin  30.84 
 
 
605 aa  263  8e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.54 
 
 
616 aa  261  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0833  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.6 
 
 
600 aa  258  3e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336086  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0322  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.24 
 
 
611 aa  256  8e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.43 
 
 
576 aa  231  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3909  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.5 
 
 
571 aa  225  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0241  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.8 
 
 
569 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0321  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.39 
 
 
568 aa  216  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0991  acyltransferase family protein  29.64 
 
 
586 aa  211  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.57 
 
 
571 aa  210  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02090  acyltransferase family protein  29.29 
 
 
583 aa  208  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.486339  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4078  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.34 
 
 
570 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2792  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.38 
 
 
605 aa  206  7e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.418841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1238  acyltransferase family protein  29.17 
 
 
619 aa  203  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.94 
 
 
638 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0842  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.26 
 
 
568 aa  197  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1159  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.75 
 
 
633 aa  196  9e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1060  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.83 
 
 
624 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2645  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.77 
 
 
569 aa  194  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.221225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3347  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.57 
 
 
638 aa  194  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1871  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.47 
 
 
571 aa  194  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.65 
 
 
629 aa  194  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.57 
 
 
638 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.313645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1056  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.65 
 
 
629 aa  193  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.429554  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2569  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.94 
 
 
573 aa  191  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1245  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.09 
 
 
591 aa  191  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975874  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2267  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.32 
 
 
579 aa  190  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2810  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.89 
 
 
630 aa  187  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1073  DNA polymerase III, alpha subunit  27.05 
 
 
571 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.475912 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0631  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.06 
 
 
571 aa  160  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0510575 
 
 
-
 
NC_002950  PG2071  hypothetical protein  26.18 
 
 
311 aa  100  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1761  putative acyltransferase  24.14 
 
 
292 aa  99.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346469  normal  0.939914 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0206  hypothetical protein  28.93 
 
 
295 aa  94  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_002950  PG1875  hemolysin  28.8 
 
 
324 aa  94  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2339  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.43 
 
 
313 aa  92.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268322  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.43 
 
 
292 aa  91.3  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0542  hypothetical protein  25 
 
 
309 aa  90.1  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3211  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.49 
 
 
304 aa  89.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0693  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.33 
 
 
303 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273678  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1983  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.33 
 
 
294 aa  87.4  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0516476  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2435  hypothetical protein  26.11 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.335175  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3082  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.08 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.941494  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3959  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.78 
 
 
316 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206377  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3660  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.58 
 
 
316 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2843  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.91 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304923  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2080  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.73 
 
 
283 aa  73.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0102269  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2932  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.92 
 
 
304 aa  73.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0467  hypothetical protein  25.99 
 
 
313 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0419567  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1876  hypothetical protein  25.52 
 
 
275 aa  68.9  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4054  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.81 
 
 
313 aa  67  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2211  hypothetical protein  23.72 
 
 
312 aa  63.5  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0854552  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  28.64 
 
 
266 aa  62  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  27.73 
 
 
287 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1138  hypothetical protein  31.09 
 
 
280 aa  60.1  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.194098  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1538  hypothetical protein  24.35 
 
 
278 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642798  normal  0.166075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0318  putative hemolysin  25.42 
 
 
316 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361608  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2017  hypothetical protein  23.5 
 
 
277 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4257  hypothetical protein  25.89 
 
 
283 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1335  putative hemolysin-like protein  29.11 
 
 
270 aa  55.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  27.64 
 
 
384 aa  55.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0412  hypothetical protein  24.9 
 
 
337 aa  54.3  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.666795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4721  hypothetical protein  27.16 
 
 
332 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  28.33 
 
 
292 aa  53.9  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1709  hypothetical protein  22.65 
 
 
277 aa  53.5  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0276647  normal  0.676906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1588  putative hemolysin-like protein  25.87 
 
 
307 aa  53.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0369  hypothetical protein  24.76 
 
 
285 aa  52.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1116  hypothetical protein  26.17 
 
 
332 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2102  hypothetical protein  26.34 
 
 
281 aa  51.6  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0408  hypothetical protein  24.39 
 
 
337 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3215  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.45 
 
 
440 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0324123 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1654  hypothetical protein  23.96 
 
 
304 aa  50.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.816423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4926  hypothetical protein  26.12 
 
 
332 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4208  hypothetical protein  26.39 
 
 
330 aa  50.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0797  hypothetical protein  27.61 
 
 
272 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.874102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1704  hypothetical protein  27.61 
 
 
301 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.372177  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2757  hypothetical protein  27.61 
 
 
338 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00398439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2621  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  24.42 
 
 
265 aa  49.3  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0630357  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1503  hypothetical protein  27.61 
 
 
272 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1533  hypothetical protein  27.61 
 
 
272 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4417  hypothetical protein  26.21 
 
 
332 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704988  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0012  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.75 
 
 
331 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785137  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4880  hypothetical protein  25.31 
 
 
332 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.055868  normal  0.748823 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1310  hypothetical protein  30.15 
 
 
250 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0560  hypothetical protein  30.15 
 
 
250 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0592  hypothetical protein  30.15 
 
 
250 aa  48.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0583  putative hemolysin-like protein  25.3 
 
 
320 aa  47.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>