164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1121 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1238  acyltransferase family protein  93.32 
 
 
619 aa  1212    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1159  phospholipid/glycerol acyltransferase  88.87 
 
 
633 aa  1165    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3347  phospholipid/glycerol acyltransferase  92.18 
 
 
638 aa  1164    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02090  acyltransferase family protein  58.2 
 
 
583 aa  691    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.486339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1245  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.31 
 
 
591 aa  707    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975874  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1056  phospholipid/glycerol acyltransferase  99.21 
 
 
629 aa  1294    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.429554  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
629 aa  1304    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2267  phospholipid/glycerol acyltransferase  73.04 
 
 
579 aa  900    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1060  phospholipid/glycerol acyltransferase  97.46 
 
 
624 aa  1268    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0991  acyltransferase family protein  68.65 
 
 
586 aa  835    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2645  phospholipid/glycerol acyltransferase  53.26 
 
 
569 aa  638    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.221225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  89.03 
 
 
638 aa  1166    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2792  phospholipid/glycerol acyltransferase  73.34 
 
 
605 aa  908    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.418841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2810  phospholipid/glycerol acyltransferase  87.9 
 
 
630 aa  1141    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  88.71 
 
 
638 aa  1162    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.313645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3909  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.48 
 
 
571 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0321  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.17 
 
 
568 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0241  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.33 
 
 
569 aa  570  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4078  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.19 
 
 
570 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.86 
 
 
571 aa  561  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2569  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.92 
 
 
573 aa  555  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1073  DNA polymerase III, alpha subunit  44.39 
 
 
571 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.475912 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.93 
 
 
576 aa  543  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1871  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.13 
 
 
571 aa  539  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0842  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.55 
 
 
568 aa  538  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0631  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.76 
 
 
571 aa  399  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0510575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0411  hemolysin  32.72 
 
 
590 aa  287  5e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2307  putative hemolysin  33.39 
 
 
607 aa  267  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0834  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.51 
 
 
583 aa  265  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2481  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.99 
 
 
626 aa  264  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.176088 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0322  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.24 
 
 
611 aa  263  8.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0590  hypothetical protein  32.23 
 
 
605 aa  259  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.803828  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1504  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.05 
 
 
597 aa  253  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000190561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0833  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.69 
 
 
600 aa  251  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336086  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02315  putative hemolysin  29.86 
 
 
605 aa  250  5e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001630  putative hemolysin  29.93 
 
 
582 aa  249  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0042  hypothetical protein  30.67 
 
 
586 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.715223  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0593  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.09 
 
 
613 aa  241  4e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00835  hypothetical protein  30.51 
 
 
587 aa  239  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.68 
 
 
616 aa  211  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.78 
 
 
636 aa  196  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0797  putative hemolysin  28.65 
 
 
591 aa  194  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0583  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.43 
 
 
584 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1875  hemolysin  31.02 
 
 
324 aa  140  8.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.25 
 
 
662 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1876  hypothetical protein  28.88 
 
 
275 aa  122  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2339  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.46 
 
 
313 aa  94.7  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268322  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3211  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.17 
 
 
304 aa  92  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1761  putative acyltransferase  30.94 
 
 
292 aa  89  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346469  normal  0.939914 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2932  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.6 
 
 
304 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2071  hypothetical protein  25 
 
 
311 aa  87.4  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3660  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.77 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3959  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.72 
 
 
316 aa  82  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206377  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.59 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0206  hypothetical protein  28.04 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4054  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.49 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2435  hypothetical protein  24.47 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.335175  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3082  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.3 
 
 
303 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.941494  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0693  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.43 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273678  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1983  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.43 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0516476  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2843  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.6 
 
 
281 aa  67  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304923  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  34.82 
 
 
258 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2080  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.93 
 
 
283 aa  65.5  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0102269  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2849  hypothetical protein  25.98 
 
 
270 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  0.909838 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0542  hypothetical protein  22.94 
 
 
309 aa  63.5  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1275  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  25.62 
 
 
270 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.599594  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0891  hypothetical protein  26.36 
 
 
271 aa  62  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0879726 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.83 
 
 
253 aa  61.2  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0143  hypothetical protein  31.72 
 
 
297 aa  60.8  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0148  hypothetical protein  31.72 
 
 
281 aa  60.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2102  hypothetical protein  30.15 
 
 
281 aa  59.3  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.82 
 
 
292 aa  59.7  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0059  hypothetical protein  25.75 
 
 
258 aa  58.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  58.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  32.59 
 
 
250 aa  57.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0418  hypothetical protein  35.92 
 
 
291 aa  57.8  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  26.97 
 
 
266 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2176  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  27.03 
 
 
283 aa  57  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.525625 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2736  putative hemolysin  27.46 
 
 
271 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  33.65 
 
 
291 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2436  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.19 
 
 
258 aa  56.2  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1654  hypothetical protein  35.51 
 
 
304 aa  55.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.816423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6049  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  30.28 
 
 
256 aa  55.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0160  hypothetical protein  30.14 
 
 
297 aa  55.1  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0583  putative hemolysin-like protein  29.08 
 
 
320 aa  55.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0412  hypothetical protein  31.73 
 
 
337 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.666795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4721  hypothetical protein  33.04 
 
 
332 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325273  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4880  hypothetical protein  31.34 
 
 
332 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.055868  normal  0.748823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4417  hypothetical protein  31.34 
 
 
332 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.704988  normal  0.744356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3452  hypothetical protein  27.12 
 
 
255 aa  53.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320745  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1726  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  30.57 
 
 
1147 aa  53.5  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  27.42 
 
 
384 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2028  hypothetical protein  31.25 
 
 
282 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.131913  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0699  hypothetical protein  32.71 
 
 
315 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4926  hypothetical protein  30.37 
 
 
332 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.263605 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3519  hypothetical protein  29.61 
 
 
261 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1116  hypothetical protein  36.94 
 
 
332 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13043  hypothetical protein  28.57 
 
 
246 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000906572  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1997  putative hemolysin-like protein  24.78 
 
 
268 aa  52  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351889  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2886  putative hemolysin-like protein  30.87 
 
 
265 aa  51.6  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.222823 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>