165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3909 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3909  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 		 571 aa  1172    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0241  phospholipid/glycerol acyltransferase  82.19 
 
 		 569 aa  995    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0321  phospholipid/glycerol acyltransferase  80.28 
 
 		 568 aa  976    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0842  phospholipid/glycerol acyltransferase  58.61 
 
 		 568 aa  697    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  95.45 
 
 		 571 aa  1096    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2569  phospholipid/glycerol acyltransferase  71.4 
 
 		 573 aa  837    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1245  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.11 
 
 		 591 aa  620  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975874  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02090  acyltransferase family protein  50.88 
 
 		 583 aa  607  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.486339  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2645  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.85 
 
 		 569 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.221225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3347  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.25 
 
 		 638 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1238  acyltransferase family protein  48.08 
 
 		 619 aa  581  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1159  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.25 
 
 		 633 aa  579  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.43 
 
 		 638 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2792  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.86 
 
 		 605 aa  580  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.418841 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1056  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.48 
 
 		 629 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.429554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.48 
 
 		 629 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2810  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.08 
 
 		 630 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.25 
 
 		 638 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.313645  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2267  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.37 
 
 		 579 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1060  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.3 
 
 		 624 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0991  acyltransferase family protein  45.41 
 
 		 586 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.95 
 
 		 576 aa  544  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4078  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.44 
 
 		 570 aa  527  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1871  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.75 
 
 		 571 aa  502  1e-141  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1073  DNA polymerase III, alpha subunit  41.91 
 
 		 571 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.475912 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0631  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.32 
 
 		 571 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510575 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0834  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.46 
 
 		 583 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0590  hypothetical protein  32.27 
 
 		 605 aa  276  7e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.803828  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0411  hemolysin  33.15 
 
 		 590 aa  275  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0042  hypothetical protein  33.95 
 
 		 586 aa  273  9e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.715223  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0322  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.9 
 
 		 611 aa  265  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00835  hypothetical protein  31.97 
 
 		 587 aa  264  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001630  putative hemolysin  31.65 
 
 		 582 aa  264  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2481  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.86 
 
 		 626 aa  259  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0833  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.8 
 
 		 600 aa  258  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336086  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02315  putative hemolysin  31.48 
 
 		 605 aa  257  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1504  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.32 
 
 		 597 aa  254  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000190561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2307  putative hemolysin  31.76 
 
 		 607 aa  251  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0593  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.79 
 
 		 613 aa  244  3.9999999999999997e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.35 
 
 		 616 aa  229  8e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0797  putative hemolysin  32.5 
 
 		 591 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.15 
 
 		 636 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0583  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.59 
 
 		 584 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.36 
 
 		 662 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1876  hypothetical protein  30.15 
 
 		 275 aa  119  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1875  hemolysin  29.12 
 
 		 324 aa  116  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2339  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.43 
 
 		 313 aa  107  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268322  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1761  putative acyltransferase  28.89 
 
 		 292 aa  97.1  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346469  normal  0.939914 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.77 
 
 		 292 aa  95.5  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2071  hypothetical protein  27.97 
 
 		 311 aa  93.6  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3211  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.4 
 
 		 304 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3660  phospholipid/glycerol acyltransferase  25 
 
 		 316 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3082  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.9 
 
 		 303 aa  89.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.941494  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4054  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.07 
 
 		 313 aa  87.8  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3959  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.39 
 
 		 316 aa  88.2  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0693  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.48 
 
 		 303 aa  87.8  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1983  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.9 
 
 		 294 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0516476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2932  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.44 
 
 		 304 aa  83.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2843  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.89 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0542  hypothetical protein  26.11 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0206  hypothetical protein  26.73 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2435  hypothetical protein  25.21 
 
 		 317 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.335175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1208  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.07 
 
 		 253 aa  65.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.32888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2080  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.8 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0102269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2886  putative hemolysin-like protein  29.5 
 
 		 265 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801461  normal  0.222823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3535  hypothetical protein  31.14 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3519  hypothetical protein  29.59 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.339526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1121  hypothetical protein  31.06 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5237  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.77 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.300645 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3826  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.21 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2211  hypothetical protein  26.82 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0854552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2436  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.39 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00586603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3768  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  31.13 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0716  hypothetical protein  24.77 
 
 		 266 aa  57  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000130069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0035  hypothetical protein  29.88 
 
 		 291 aa  56.2  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0418  hypothetical protein  33.87 
 
 		 291 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1440  ornithine-acyl(acyl carrier protein) N- acyltransferase  33.94 
 
 		 261 aa  54.7  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.907823 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1116  hypothetical protein  29.06 
 
 		 332 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.719302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0369  hypothetical protein  23.05 
 
 		 285 aa  53.9  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1472  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.19 
 
 		 258 aa  53.9  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.031802  normal  0.0574374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3681  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  28.03 
 
 		 292 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1727  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.6 
 
 		 201 aa  53.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00676958  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0050  hypothetical protein  29.54 
 
 		 291 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0148  hypothetical protein  32.67 
 
 		 281 aa  52.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2103  hypothetical protein  30.58 
 
 		 287 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1616  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.19 
 
 		 271 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.79755  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0143  hypothetical protein  32.67 
 
 		 297 aa  52.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3258  hypothetical protein  27.68 
 
 		 291 aa  52.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0333  putative hemolysin-like protein  27.84 
 
 		 384 aa  52.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.515717  normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2102  hypothetical protein  31.16 
 
 		 281 aa  51.2  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1789  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  30.46 
 
 		 258 aa  50.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3597  hypothetical protein  29.88 
 
 		 341 aa  50.8  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.485263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3934  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  26.88 
 
 		 250 aa  50.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.638634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0699  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1873  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.17 
 
 		 277 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.447204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1919  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.17 
 
 		 277 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456889  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1853  ornithine-acyl[acyl carrier protein] N-acyltransferase  29.17 
 
 		 277 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13043  hypothetical protein  34.48 
 
 		 246 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000906572  hitchhiker  0.00196121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2912  hypothetical protein  30.77 
 
 		 267 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0713  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.81 
 
 		 203 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>