69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0206 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0206  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  603  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2435  hypothetical protein  62.96 
 
 		 317 aa  351  7e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.335175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0542  hypothetical protein  58.98 
 
 		 309 aa  341  7e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1761  putative acyltransferase  36.47 
 
 		 292 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346469  normal  0.939914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2339  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.83 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268322  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.23 
 
 		 292 aa  188  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0590  hypothetical protein  34.07 
 
 		 605 aa  135  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.803828  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1504  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.71 
 
 		 597 aa  129  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000190561 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0411  hemolysin  33.33 
 
 		 590 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0042  hypothetical protein  32.39 
 
 		 586 aa  126  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.715223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.75 
 
 		 662 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001630  putative hemolysin  31.45 
 
 		 582 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00835  hypothetical protein  31.05 
 
 		 587 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0593  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.53 
 
 		 613 aa  116  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2080  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.83 
 
 		 283 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0102269  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 		 616 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02315  putative hemolysin  29.57 
 
 		 605 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0834  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.4 
 
 		 583 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0833  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.64 
 
 		 600 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336086  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.6 
 
 		 636 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2645  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.42 
 
 		 569 aa  97.8  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.221225 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2481  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.71 
 
 		 626 aa  97.4  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176088 
 
 
-
 
NC_002950  PG2071  hypothetical protein  29.27 
 
 		 311 aa  96.3  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0693  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.19 
 
 		 303 aa  95.5  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2307  putative hemolysin  28.57 
 
 		 607 aa  94.7  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1983  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.71 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0516476  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0797  putative hemolysin  28.93 
 
 		 591 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0583  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.13 
 
 		 584 aa  93.6  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0322  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.63 
 
 		 611 aa  93.2  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3082  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.71 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.941494  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0842  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.7 
 
 		 568 aa  90.1  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3347  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.91 
 
 		 638 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.91 
 
 		 638 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.313645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1159  phospholipid/glycerol acyltransferase  30 
 
 		 633 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  29 
 
 		 638 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2810  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.97 
 
 		 630 aa  79  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4054  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.23 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1238  acyltransferase family protein  28.5 
 
 		 619 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.04 
 
 		 629 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1056  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.04 
 
 		 629 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.429554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1060  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.04 
 
 		 624 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3211  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.78 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0241  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.77 
 
 		 569 aa  76.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2267  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.98 
 
 		 579 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3909  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.73 
 
 		 571 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0321  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.74 
 
 		 568 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2569  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.35 
 
 		 573 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.73 
 
 		 571 aa  73.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0991  acyltransferase family protein  25.84 
 
 		 586 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0631  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.72 
 
 		 571 aa  72.4  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2792  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.64 
 
 		 605 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.418841 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02090  acyltransferase family protein  26.04 
 
 		 583 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.486339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1073  DNA polymerase III, alpha subunit  26.78 
 
 		 571 aa  68.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.475912 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2843  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.5 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.05 
 
 		 576 aa  62.4  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4078  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.96 
 
 		 570 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1245  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.58 
 
 		 591 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975874  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3959  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.86 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1871  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.67 
 
 		 571 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2932  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.47 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3660  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.29 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0012  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.73 
 
 		 331 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785137  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4052  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.81 
 
 		 222 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442054  normal  0.509818 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1727  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.3 
 
 		 201 aa  49.7  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00676958  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1876  hypothetical protein  25.71 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4248  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.91 
 
 		 317 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.876702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1147  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.13 
 
 		 192 aa  45.8  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  30.88 
 
 		 635 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.23 
 
 		 277 aa  42.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.938758  normal  0.157607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>