67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1761 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1761  putative acyltransferase  100 
 
 
292 aa  594  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346469  normal  0.939914 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  66.32 
 
 
292 aa  424  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2339  phospholipid/glycerol acyltransferase  67.37 
 
 
313 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268322  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0206  hypothetical protein  36.47 
 
 
295 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2435  hypothetical protein  34.46 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.335175  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0542  hypothetical protein  35.66 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0590  hypothetical protein  32.67 
 
 
605 aa  136  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.803828  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0411  hemolysin  33.06 
 
 
590 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0593  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.74 
 
 
613 aa  132  6e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0834  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.89 
 
 
583 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2080  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.43 
 
 
283 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0102269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1504  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.42 
 
 
597 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000190561 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00835  hypothetical protein  29.78 
 
 
587 aa  125  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.29 
 
 
616 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.29 
 
 
662 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001630  putative hemolysin  28.89 
 
 
582 aa  122  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0833  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.04 
 
 
600 aa  115  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336086  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0042  hypothetical protein  28.46 
 
 
586 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.715223  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02315  putative hemolysin  30.31 
 
 
605 aa  113  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2307  putative hemolysin  28.51 
 
 
607 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.17 
 
 
636 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2071  hypothetical protein  31.73 
 
 
311 aa  107  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2481  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.21 
 
 
626 aa  106  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.176088 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0322  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.91 
 
 
611 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0321  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.67 
 
 
568 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0241  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.56 
 
 
569 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2569  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.81 
 
 
573 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0797  putative hemolysin  24.14 
 
 
591 aa  99.4  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.33 
 
 
571 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3909  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.89 
 
 
571 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4054  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.88 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.47 
 
 
638 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.08 
 
 
638 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.313645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1159  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.08 
 
 
633 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3347  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.08 
 
 
638 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.29 
 
 
576 aa  90.1  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1056  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.69 
 
 
629 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.429554  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.69 
 
 
629 aa  89.7  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1238  acyltransferase family protein  30.94 
 
 
619 aa  89.7  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2810  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.01 
 
 
630 aa  89.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2645  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.55 
 
 
569 aa  89  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.221225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1060  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.94 
 
 
624 aa  89  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0583  phospholipid/glycerol acyltransferase  25 
 
 
584 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0693  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.57 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273678  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1983  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.12 
 
 
294 aa  85.5  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0516476  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02090  acyltransferase family protein  30.84 
 
 
583 aa  85.1  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.486339  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2267  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.39 
 
 
579 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103788  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3082  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.68 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.941494  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0842  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.15 
 
 
568 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0991  acyltransferase family protein  28.83 
 
 
586 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2792  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.21 
 
 
605 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.418841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1073  DNA polymerase III, alpha subunit  24.89 
 
 
571 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.475912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1245  phospholipid/glycerol acyltransferase  28 
 
 
591 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975874  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1871  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.2 
 
 
571 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0631  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.4 
 
 
571 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0510575 
 
 
-
 
NC_002950  PG1876  hypothetical protein  25.75 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2843  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.66 
 
 
281 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304923  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3211  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.56 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2932  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.79 
 
 
304 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4078  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.33 
 
 
570 aa  62.4  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3959  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.73 
 
 
316 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206377  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3660  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.71 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1727  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.91 
 
 
201 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00676958  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1147  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.61 
 
 
192 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1605  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.16 
 
 
192 aa  47  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0687  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.76 
 
 
242 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2794  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.55 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.117453 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>