100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4054 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4054  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 		 313 aa  625  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3082  phospholipid/glycerol acyltransferase  61.48 
 
 		 303 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.941494  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0693  phospholipid/glycerol acyltransferase  60.78 
 
 		 303 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1983  phospholipid/glycerol acyltransferase  60.78 
 
 		 294 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0516476  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3211  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.06 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3959  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.18 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2932  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.55 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3660  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.15 
 
 		 316 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2843  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.72 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0411  hemolysin  31.4 
 
 		 590 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0590  hypothetical protein  34.15 
 
 		 605 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.803828  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02315  putative hemolysin  35.16 
 
 		 605 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001630  putative hemolysin  29.84 
 
 		 582 aa  100  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00835  hypothetical protein  30.37 
 
 		 587 aa  99  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0042  hypothetical protein  34.64 
 
 		 586 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.715223  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1761  putative acyltransferase  33.88 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.346469  normal  0.939914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2021  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.53 
 
 		 576 aa  96.3  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0322  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.87 
 
 		 611 aa  95.1  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1504  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.63 
 
 		 597 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000190561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0321  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.28 
 
 		 568 aa  92.8  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.48 
 
 		 662 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.61 
 
 		 571 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2569  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.95 
 
 		 573 aa  90.5  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0241  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.33 
 
 		 569 aa  89.4  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0842  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.65 
 
 		 568 aa  89.4  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0631  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.82 
 
 		 571 aa  89  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0510575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1073  DNA polymerase III, alpha subunit  28.18 
 
 		 571 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.475912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.64 
 
 		 636 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0833  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.43 
 
 		 600 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336086  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0834  phospholipid/glycerol acyltransferase  28 
 
 		 583 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3909  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.07 
 
 		 571 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2339  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.37 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.268322  normal  0.813892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2481  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.37 
 
 		 626 aa  86.3  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176088 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2645  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.94 
 
 		 569 aa  85.9  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.221225 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.9 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.32 
 
 		 616 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2267  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.02 
 
 		 579 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103788  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0593  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.05 
 
 		 613 aa  82  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.85 
 
 		 638 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2307  putative hemolysin  32.38 
 
 		 607 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.4 
 
 		 638 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.313645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3347  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.83 
 
 		 638 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1159  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.4 
 
 		 633 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0206  hypothetical protein  27.23 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1238  acyltransferase family protein  26.98 
 
 		 619 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2810  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.48 
 
 		 630 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02090  acyltransferase family protein  27.31 
 
 		 583 aa  76.3  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.486339  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1245  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.91 
 
 		 591 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975874  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2792  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.23 
 
 		 605 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.418841 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1060  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.05 
 
 		 624 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2071  hypothetical protein  32.07 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1871  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.7 
 
 		 571 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0991  acyltransferase family protein  27.27 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.49 
 
 		 629 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1056  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.49 
 
 		 629 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.429554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0542  hypothetical protein  27.2 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4078  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.69 
 
 		 570 aa  72.8  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1876  hypothetical protein  27.88 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0583  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.35 
 
 		 584 aa  70.9  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2435  hypothetical protein  23.83 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.335175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0797  putative hemolysin  26.81 
 
 		 591 aa  67  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2080  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.83 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0102269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1727  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.14 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00676958  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1147  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.04 
 
 		 192 aa  53.9  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0841  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.82 
 
 		 356 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 958 aa  49.3  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0071  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.73 
 
 		 356 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0627764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1964  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.19 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0179  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.91 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196105  normal  0.76032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1106  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  29.47 
 
 		 1114 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10513  hypothetical protein  31.52 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0545  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.06 
 
 		 195 aa  47  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.585305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0339  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.01 
 
 		 888 aa  47  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169342 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2101  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.16 
 
 		 194 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0012  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.85 
 
 		 331 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785137  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0713  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.59 
 
 		 203 aa  46.2  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107565  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  27.86 
 
 		 936 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0672  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.24 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0685  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.24 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190716  normal  0.183519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1417  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.87 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0665  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.24 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.19 
 
 		 635 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4248  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.876702  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1249  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acetyltransferase, putative  26.43 
 
 		 204 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1605  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.72 
 
 		 192 aa  43.9  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1252  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.11 
 
 		 275 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0979413 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0302  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  29.95 
 
 		 1124 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1232  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.45 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  27.14 
 
 		 852 aa  43.5  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3732  putative transmembrane protein  27.33 
 
 		 632 aa  43.5  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.896523 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0785  AMP-dependent synthetase and ligase  24.28 
 
 		 824 aa  43.5  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0432  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.5 
 
 		 212 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0360241  hitchhiker  0.00110988 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0070  AMP-dependent synthetase and ligase  23.67 
 
 		 717 aa  43.1  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0187  acyltransferase family protein  27.06 
 
 		 618 aa  43.1  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0791415 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0595  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.09 
 
 		 203 aa  42.7  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0346  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.93 
 
 		 290 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.31 
 
 		 635 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0176681 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0537  phospholipid/glycerol acyltransferase  25 
 
 		 654 aa  42.7  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160332 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0416  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.56 
 
 		 290 aa  42.7  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.378719  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1552  hypothetical protein  26.85 
 
 		 626 aa  42.4  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>