73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4248 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4248  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
317 aa  633  1e-180  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.876702  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0012  phospholipid/glycerol acyltransferase  92.62 
 
 
331 aa  547  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785137  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2580  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.48 
 
 
302 aa  185  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.43 
 
 
277 aa  172  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.938758  normal  0.157607 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0593  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.94 
 
 
613 aa  59.7  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0590  hypothetical protein  30.71 
 
 
605 aa  57  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.803828  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.24 
 
 
662 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0583  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.63 
 
 
584 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0321  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.04 
 
 
568 aa  53.9  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1504  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.41 
 
 
597 aa  53.5  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000190561 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3082  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.77 
 
 
303 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.941494  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2307  putative hemolysin  35.46 
 
 
607 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0842  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.17 
 
 
568 aa  52.8  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.71 
 
 
571 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00835  hypothetical protein  27.46 
 
 
587 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.56 
 
 
636 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2810  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.17 
 
 
630 aa  50.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1056  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.17 
 
 
629 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.429554  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4060  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.36 
 
 
231 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0693  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.56 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273678  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0411  hemolysin  27.34 
 
 
590 aa  50.1  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1060  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.17 
 
 
624 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.17 
 
 
629 aa  50.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2267  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.65 
 
 
579 aa  50.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103788  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001630  putative hemolysin  26.62 
 
 
582 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0241  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.46 
 
 
569 aa  50.1  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1983  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.56 
 
 
294 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0516476  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3974  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.1 
 
 
231 aa  50.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000150159  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0982  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.66 
 
 
266 aa  49.7  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.200172  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0042  hypothetical protein  27.66 
 
 
586 aa  49.7  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.715223  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14270  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29 
 
 
244 aa  49.3  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2569  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.36 
 
 
573 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3909  phospholipid/glycerol acyltransferase  30 
 
 
571 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1238  acyltransferase family protein  35.11 
 
 
619 aa  49.3  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02090  acyltransferase family protein  29.85 
 
 
583 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.486339  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3660  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.28 
 
 
316 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.11 
 
 
638 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1245  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.72 
 
 
591 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4396  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.44 
 
 
232 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000345745  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1159  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.78 
 
 
633 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2792  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.04 
 
 
605 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.418841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0644  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.04 
 
 
235 aa  47.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.54251e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.78 
 
 
638 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.313645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3347  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.78 
 
 
638 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1330  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  28.21 
 
 
193 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000270973  normal  0.0367266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3959  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.12 
 
 
316 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206377  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0206  hypothetical protein  30.91 
 
 
295 aa  46.2  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1156  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
220 aa  46.2  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0704945  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1036  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.29 
 
 
272 aa  46.2  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1727  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.39 
 
 
201 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00676958  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1439  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.56 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.358229 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4054  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4184  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.07 
 
 
620 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3044  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.21 
 
 
238 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000160916  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.07 
 
 
620 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0405  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.35 
 
 
626 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0797  putative hemolysin  26.79 
 
 
591 aa  44.3  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1819  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  35.45 
 
 
211 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.368022  hitchhiker  0.00226869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0559  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.64 
 
 
219 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3128  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.35 
 
 
284 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.520378  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13770  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.57 
 
 
235 aa  43.9  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0506817  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1904  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.78 
 
 
264 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0167165  hitchhiker  0.000224701 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0175  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.79 
 
 
620 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.292728 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2932  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.9 
 
 
304 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.572672  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.81 
 
 
616 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0363  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.36 
 
 
234 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000581696  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1851  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.17 
 
 
223 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0991  acyltransferase family protein  31.91 
 
 
586 aa  43.1  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0171  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.19 
 
 
620 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0833  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.72 
 
 
600 aa  43.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336086  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1439  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.91 
 
 
202 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00225818  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0053  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.52 
 
 
214 aa  42.7  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.639478  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2270  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.66 
 
 
239 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000119102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>