46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0012 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0012  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
331 aa  660    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.785137  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4248  phospholipid/glycerol acyltransferase  92.62 
 
 
317 aa  526  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.876702  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2580  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.37 
 
 
302 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.29 
 
 
277 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.938758  normal  0.157607 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0593  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.65 
 
 
613 aa  61.6  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0590  hypothetical protein  29.86 
 
 
605 aa  56.2  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.803828  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1504  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.14 
 
 
597 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000190561 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00835  hypothetical protein  28.57 
 
 
587 aa  54.7  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0042  hypothetical protein  27.66 
 
 
586 aa  53.9  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.715223  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0583  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.7 
 
 
584 aa  51.6  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0842  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.61 
 
 
568 aa  51.6  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001630  putative hemolysin  26.57 
 
 
582 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0206  hypothetical protein  32.73 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3082  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.05 
 
 
303 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.941494  normal  0.959202 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3661  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.38 
 
 
636 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0693  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.82 
 
 
303 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.273678  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1983  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.82 
 
 
294 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0516476  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2169  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.29 
 
 
662 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0321  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.98 
 
 
568 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02090  acyltransferase family protein  36.17 
 
 
583 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.486339  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0797  putative hemolysin  26.75 
 
 
591 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0411  hemolysin  27.4 
 
 
590 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.517825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0248  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.93 
 
 
229 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0653218  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4396  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.44 
 
 
232 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000345745  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.57 
 
 
571 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0241  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.91 
 
 
569 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2307  putative hemolysin  33.33 
 
 
607 aa  46.2  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4054  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.85 
 
 
313 aa  46.2  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2569  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.09 
 
 
573 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3909  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.79 
 
 
571 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2435  hypothetical protein  32.41 
 
 
317 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.335175  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1727  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.03 
 
 
201 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00676958  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3660  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.44 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3959  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.08 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.206377  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1060  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.04 
 
 
624 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0834  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.97 
 
 
583 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16421  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2810  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.04 
 
 
630 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2267  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.22 
 
 
579 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103788  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1121  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.04 
 
 
629 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1056  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.04 
 
 
629 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.429554  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3974  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.36 
 
 
231 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000150159  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2923  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.81 
 
 
616 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917125  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1238  acyltransferase family protein  32.98 
 
 
619 aa  43.1  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1245  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.91 
 
 
591 aa  43.1  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.975874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3208  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.98 
 
 
638 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4060  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.21 
 
 
231 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>